TRPC5

TRPC5
Ідентифікатори
Символи	TRPC5, PPP1R159, TRP5, transient receptor potential cation channel subfamily C member 5
Зовнішні ІД	OMIM: 300334 MGI: 109524 HomoloGene: 74915 GeneCards: TRPC5
Реагує на сполуку
	Розиглітазон, Дайджеїн, Геністейн, 2-aminoethoxydiphenylborate, прогестерон, хлорпромазин, flufenamic acid
Онтологія гена
Молекулярна функція	• inositol 1,4,5 trisphosphate binding; • ion channel activity; • store-operated calcium channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • calcium channel activity; • clathrin binding; • actin binding; • actinin binding; • ATPase binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • Кальцієві канали; • мембрана; • цитоплазма; • growth cone; • soma; • дендрит (нейробіологія); • membrane raft; • катіонний канал;
Біологічний процес	• manganese ion transport; • ion transport; • regulation of cytosolic calcium ion concentration; • calcium ion transmembrane transport; • calcium ion transport; • нейробіологія розвитку; • regulation of membrane hyperpolarization; • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation; • positive regulation of axon extension; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • neuron differentiation; • positive regulation of neuron differentiation; • negative regulation of dendrite morphogenesis; • трансмембранний транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7224
	22067
	ENSG00000072315
	ENSMUSG00000041710
	Q9UL62
	Q9QX29
	NM_012471
	NM_009428
	NP_036603
	NP_033454
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRPC5 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 973 амінокислот, а молекулярна маса — 111 412^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQLYYKKVN	YSPYRDRIPL	QIVRAETELS	AEEKAFLNAV	EKGDYATVKQ
ALQEAEIYYN	VNINCMDPLG	RSALLIAIEN	ENLEIMELLL	NHSVYVGDAL
LYAIRKEVVG	AVELLLSYRR	PSGEKQVPTL	MMDTQFSEFT	PDITPIMLAA
HTNNYEIIKL	LVQKRVTIPR	PHQIRCNCVE	CVSSSEVDSL	RHSRSRLNIY
KALASPSLIA	LSSEDPILTA	FRLGWELKEL	SKVENEFKAE	YEELSQQCKL
FAKDLLDQAR	SSRELEIILN	HRDDHSEELD	PQKYHDLAKL	KVAIKYHQKE
FVAQPNCQQL	LATLWYDGFP	GWRRKHWVVK	LLTCMTIGFL	FPMLSIAYLI
SPRSNLGLFI	KKPFIKFICH	TASYLTFLFM	LLLASQHIVR	TDLHVQGPPP
TVVEWMILPW	VLGFIWGEIK	EMWDGGFTEY	IHDWWNLMDF	AMNSLYLATI
SLKIVAYVKY	NGSRPREEWE	MWHPTLIAEA	LFAISNILSS	LRLISLFTAN
SHLGPLQISL	GRMLLDILKF	LFIYCLVLLA	FANGLNQLYF	YYETRAIDEP
NNCKGIRCEK	QNNAFSTLFE	TLQSLFWSVF	GLLNLYVTNV	KARHEFTEFV
GATMFGTYNV	ISLVVLLNML	IAMMNNSYQL	IADHADIEWK	FARTKLWMSY
FDEGGTLPPP	FNIIPSPKSF	LYLGNWFNNT	FCPKRDPDGR	RRRRNLRSFT
ERNADSLIQN	QHYQEVIRNL	VKRYVAAMIR	NSKTHEGLTE	ENFKELKQDI
SSFRYEVLDL	LGNRKHPRSF	STSSTELSQR	DDNNDGSGGA	RAKSKSVSFN
LGCKKKTCHG	PPLIRTMPRS	SGAQGKSKAE	SSSKRSFMGP	SLKKLGLLFS
KFNGHMSEPS	SEPMYTISDG	IVQQHCMWQD	IRYSQMEKGK	AEACSQSEIN
LSEVELGEVQ	GAAQSSECPL	ACSSSLHCAS	SICSSNSKLL	DSSEDVFETW
GEACDLLMHK	WGDGQEEQVT	TRL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 doi:10.1073/pnas.102596199
Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 doi:10.1016/j.ceca.2007.07.009

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12337 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-04-18 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9UL62 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12337 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-04-18 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q9UL62 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]