Ядерний хлорний канал 1

Ядерний хлорний канал 1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1K0M, 1K0N, 1K0O, 1RK4, 3O3T, 3P8W, 3P90, 3QR6, 3SWL, 3TGZ, 3UVH, 4IQA, 4JZQ, 4K0G, 4K0N
Ідентифікатори
Символи	CLIC1, G6, NCC27, chloride intracellular channel 1, CL1C1, CLCNL1
Зовнішні ІД	OMIM: 602872 MGI: 2148924 HomoloGene: 20343 GeneCards: CLIC1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• voltage-gated ion channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • chloride channel activity; • cadherin binding; • glutathione transferase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • везикула; • ядерна мембрана; • blood microparticle; • nuclear envelope; • мембрана; • клітинна мембрана; • chloride channel complex; • мітохондрія; • brush border; • perinuclear region of cytoplasm; • екзосома; • клітинне ядро; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• regulation of ion transmembrane transport; • ion transport; • regulation of cell cycle; • regulation of mitochondrial membrane potential; • positive regulation of osteoblast differentiation; • chloride transport; • platelet aggregation; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • chloride transmembrane transport; • glutathione metabolic process; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1192
	114584
ENSG00000213719; ENSG00000223639; ENSG00000226248; ENSG00000226651; ENSG00000226417;
	ENSG00000230685; ENSG00000206394
	ENSMUSG00000007041
	O00299
	Q9Z1Q5
	NM_001288; NM_001287593; NM_001287594
	NM_033444
	NP_001274522; NP_001274523; NP_001279
	NP_254279
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Ядерний хлорний канал 1 (англ. Chloride intracellular channel 1) – білок, який кодується геном CLIC1, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 241 амінокислот, а молекулярна маса — 26 923^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEEQPQVEL	FVKAGSDGAK	IGNCPFSQRL	FMVLWLKGVT	FNVTTVDTKR
RTETVQKLCP	GGQLPFLLYG	TEVHTDTNKI	EEFLEAVLCP	PRYPKLAALN
PESNTAGLDI	FAKFSAYIKN	SNPALNDNLE	KGLLKALKVL	DNYLTSPLPE
EVDETSAEDE	GVSQRKFLDG	NELTLADCNL	LPKLHIVQVV	CKKYRGFTIP
EAFRGVHRYL	SNAYAREEFA	STCPDDEEIE	LAYEQVAKAL	K

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Berryman M., Bretscher A. (2000). Identification of a novel member of the chloride intracellular channel gene family (CLIC5) that associates with the actin cytoskeleton of placental microvilli. Mol. Biol. Cell. 11: 1509—1521. PMID 10793131 doi:10.1091/mbc.11.5.1509
Tulk B.M., Kapadia S., Edwards J.C. (2002). CLIC1 inserts from the aqueous phase into phospholipid membranes, where it functions as an anion channel. Am. J. Physiol. 282: C1103—C1112. PMID 11940526 doi:10.1152/ajpcell.00402.2001
Fan L., Yu W., Zhu X. (2003). Interaction of sedlin with chloride intracellular channel proteins. FEBS Lett. 540: 77—80. PMID 12681486 doi:10.1016/S0014-5793(03)00228-X
Fanucchi S., Adamson R.J., Dirr H.W. (2008). Formation of an unfolding intermediate state of soluble chloride intracellular channel protein CLIC1 at acidic pH. Biochemistry. 47: 11674—11681. PMID 18850721 doi:10.1021/bi801147r
Chuang J.Z., Milner T.A., Zhu M., Sung C.H. (1999). A 29 kDa intracellular chloride channel p64H1 is associated with large dense-core vesicles in rat hippocampal neurons. J. Neurosci. 19: 2919—2928. PMID 10191309

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2062 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O00299 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2062 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O00299 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]