CLCNKA

CLCNKA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PFI
Ідентифікатори
Символи	CLCNKA, CLCK1, ClC-K1, hClC-Ka, chloride voltage-gated channel Ka
Зовнішні ІД	OMIM: 602024 MGI: 1930643 HomoloGene: 107317 GeneCards: CLCNKA
Пов'язані генетичні захворювання
Bartter disease type 4b
Реагує на сполуку
niflumic acid, DIDS
Онтологія гена Молекулярна функція • зв’язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • chloride channel activity • voltage-gated chloride channel activity • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • chloride channel complex • мембрана Біологічний процес • ion transmembrane transport • chloride transport • виділення • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • трансмембранний транспорт • chloride transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1187	56365
Ensembl	ENSG00000186510	ENSMUSG00000006216
UniProt	P51800	Q9WUB6
RefSeq (мРНК)	NM_004070 NM_001042704 NM_001257139	NM_019701
RefSeq (білок)	NP_001036169 NP_001244068 NP_004061	NP_062675
Локус (UCSC)	Хр. 1: 16.02 – 16.03 Mb	Хр. 4: 141.13 – 141.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLCNKA (англ. Chloride voltage-gated channel Ka) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 687 амінокислот, а молекулярна маса — 75 285.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEELVGLREG		FSGDPVTLQE		LWGPCPHIRR		AIQGGLEWLK		QKVFRLGEDW
YFLMTLGVLM		ALVSYAMNFA		IGCVVRAHQW		LYREIGDSHL		LRYLSWTVYP
VALVSFSSGF		SQSITPSSGG		SGIPELKTML		AGVILEDYLD		IKNFGAKVVG
LSCTLATGST		LFLGKVGPFV		HLSVMIAAYL		GRVRTTTIGE		PENKSKQNEM
LVAAAAVGVA		TVFAAPFSGV		LFSIEVMSSH		FSVRDYWRGF		FAATCGAFIF
RLLAVFNSEQ		ETITSLYKTS		FRVDVPFDLP		EIFFFVALGG		ICGVLSCAYL
FCQRTFLSFI		KTNRYSSKLL		ATSKPVYSAL		ATLLLASITY		PPGVGHFLAS
RLSMKQHLDS		LFDNHSWALM		TQNSSPPWPE		ELDPQHLWWE		WYHPRFTIFG
TLAFFLVMKF		WMLILATTIP		MPAGYFMPIF		ILGAAIGRLL		GEALAVAFPE
GIVTGGVTNP		IMPGGYALAG		AAAFSGAVTH		TISTALLAFE		LTGQIVHALP
VLMAVLAANA		IAQSCQPSFY		DGTIIVKKLP		YLPRILGRNI		GSHHVRVEHF
MNHSITTLAK		DTPLEEVVKV		VTSTDVTEYP		LVESTESQIL		VGIVQRAQLV
QALQAEPPSR		APGHQQCLQD		ILARGCPTEP		VTLTLFSETT		LHQAQNLFKL
LNLQSLFVTS		RGRAVGCVSW		VEMKKAISNL		TNPPAPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у мембрані.

Література

• Kieferle S., Fong P., Bens M., Vandewalle A., Jentsch T. (1994). Two highly homologous members of the ClC chloride channel family in both rat and human kidney. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6943—6947. PMID 8041726 doi:10.1073/pnas.91.15.6943
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Gradogna A., Fenollar-Ferrer C., Forrest L.R., Pusch M. (2012). Dissecting a regulatory calcium-binding site of CLC-K kidney chloride channels. J. Gen. Physiol. 140: 681—696. PMID 23148261 doi:10.1085/jgp.201210878
• Markovic S., Dutzler R. (2007). The structure of the cytoplasmic domain of the chloride channel ClC-Ka reveals a conserved interaction interface. Structure. 15: 715—725. PMID 17562318 doi:10.1016/j.str.2007.04.013

Див. також

• Хромосома 1