CLIC3

CLIC3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3FY7, 3KJY
Ідентифікатори
Символи	CLIC3, chloride intracellular channel 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606533 MGI: 1916704 HomoloGene: 3432 GeneCards: CLIC3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • voltage-gated ion channel activity • chloride channel activity • glutathione transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • екзосома • мембрана • клітинне ядро • chloride channel complex • ядерні тільця Біологічний процес • regulation of ion transmembrane transport • chloride transport • ion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • chloride transmembrane transport • glutathione metabolic process • GO:0015915 транспорт • ion transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9022	69454
Ensembl	ENSG00000169583	ENSMUSG00000015093
UniProt	O95833	Q9D7P7
RefSeq (мРНК)	NM_004669	NM_027085
RefSeq (білок)	NP_004660	NP_081361
Локус (UCSC)	Хр. 9: 136.99 – 137 Mb	Хр. 2: 25.35 – 25.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLIC3 (англ. Chloride intracellular channel 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 26 648.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAETKLQLFV		KASEDGESVG		HCPSCQRLFM		VLLLKGVPFT		LTTVDTRRSP
DVLKDFAPGS		QLPILLYDSD		AKTDTLQIED		FLEETLGPPD		FPSLAPRYRE
SNTAGNDVFH		KFSAFIKNPV		PAQDEALYQQ		LLRALARLDS		YLRAPLEHEL
AGEPQLRESR		RRFLDGDRLT		LADCSLLPKL		HIVDTVCAHF		RQAPIPAELR
GVRRYLDSAM		QEKEFKYTCP		HSAEILAAYR		PAVHPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Qian Z., Okuhara D., Abe M.K., Rosner M.R. (1999). Molecular cloning and characterization of a mitogen-activated protein kinase-associated intracellular chloride channel. J. Biol. Chem. 274: 1621—1627. PMID 9880541 doi:10.1074/jbc.274.3.1621
• Littler D.R., Brown L.J., Breit S.N., Perrakis A., Curmi P.M. (2010). Structure of human CLIC3 at 2 A resolution. Proteins. 78: 1594—1600. PMID 20146363 doi:10.1002/prot.22675

Див. також

• Хромосома 9