SPIB

SPIB
Ідентифікатори
Символи	SPIB, SPI-B, Spi-B transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 606802 MGI: 892986 HomoloGene: 79220 GeneCards: SPIB
Пов'язані генетичні захворювання
primary biliary cholangitis
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6689	272382
Ensembl	ENSG00000269404	ENSMUSG00000008193
UniProt	Q01892	O35906
RefSeq (мРНК)	NM_003121 NM_001243998 NM_001243999 NM_001244000	NM_019866
RefSeq (білок)	NP_001230927 NP_001230928 NP_001230929 NP_003112	NP_063919
Локус (UCSC)	Хр. 19: 50.42 – 50.43 Mb	Хр. 7: 44.18 – 44.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPIB (англ. Spi-B transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 262 амінокислот, а молекулярна маса — 28 819.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLALEAAQLD		GPHFSCLYPD		GVFYDLDSCK		HSSYPDSEGA		PDSLWDWTVA
PPVPATPYEA		FDPAAAAFSH		PQAAQLCYEP		PTYSPAGNLE		LAPSLEAPGP
GLPAYPTENF		ASQTLVPPAY		APYPSPVLSE		EEDLPLDSPA		LEVSDSESDE
ALVAGPEGKG		SEAGTRKKLR		LYQFLLGLLT		RGDMRECVWW		VEPGAGVFQF
SSKHKELLAR		RWGQQKGNRK		RMTYQKLARA		LRNYAKTGEI		RKVKRKLTYQ
FDSALLPAVR		RA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Ray-Gallet D., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. (1996). An alternatively spliced isoform of the Spi-B transcription factor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 223: 257—263. PMID 8670269 doi:10.1006/bbrc.1996.0881
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon M.C. (1999). SPI-B activates transcription via a unique proline, serine, and threonine domain and exhibits DNA binding affinity differences from PU.1. J. Biol. Chem. 274: 11115—11124. PMID 10196196 doi:10.1074/jbc.274.16.11115
• Nagy M., Chapuis B., Matthes T. (2002). Expression of transcription factors Pu.1, Spi-B, Blimp-1, BSAP and oct-2 in normal human plasma cells and in multiple myeloma cells. Br. J. Haematol. 116: 429—435. PMID 11841448 doi:10.1046/j.1365-2141.2002.03271.x
• Schotte R., Nagasawa M., Weijer K., Spits H., Blom B. (2004). The ETS transcription factor Spi-B is required for human plasmacytoid dendritic cell development. J. Exp. Med. 200: 1503—1509. PMID 15583020 doi:10.1084/jem.20041231

Див. також

• Хромосома 19