RFX5

RFX5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KW3, 3V30
Ідентифікатори
Символи	RFX5, regulatory factor X5
Зовнішні ІД	OMIM: 601863 HomoloGene: 388 GeneCards: RFX5
Пов'язані генетичні захворювання
bare lymphocyte syndrome 2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5993	310659
Ensembl	ENSG00000143390	ENSRNOG00000021012
UniProt	P48382	D3ZHD7
RefSeq (мРНК)	NM_000449 NM_001025603	NM_001107694
RefSeq (білок)	NP_000440 NP_001020774 NP_001366341 NP_001366342 NP_001366343 NP_001366344 NP_001366345 NP_001366346 NP_001366347 NP_001366348 NP_001366349	NP_001101164
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.34 – 151.35 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RFX5 (англ. Regulatory factor X5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 616 амінокислот, а молекулярна маса — 65 323.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEDEPDAKS		PKTGGRAPPG		GAEAGEPTTL		LQRLRGTISK		AVQNKVEGIL
QDVQKFSDND		KLYLYLQLPS		GPTTGDKSSE		PSTLSNEEYM		YAYRWIRNHL
EEHTDTCLPK		QSVYDAYRKY		CESLACCRPL		STANFGKIIR		EIFPDIKARR
LGGRGQSKYC		YSGIRRKTLV		SMPPLPGLDL		KGSESPEMGP		EVTPAPRDEL
VEAACALTCD		WAERILKRSF		SSIVEVARFL		LQQHLISARS		AHAHVLKAMG
LAEEDEHAPR		ERSSKPKNGL		ENPEGGAHKK		PERLAQPPKD		LEARTGAGPL
ARGERKKSVV		ESSAPGANNL		QVNALVARLP		LLLPRAPRSL		IPPIPVSPPI
LAPRLSSGAL		KVATLPLSSR		AGAPPAAVPI		INMILPTVPA		LPGPGPGPGR
APPGGLTQPR		GTENREVGIG		GDQGPHDKGV		KRTAEVPVSE		ASGQAPPAKA
AKQDIEDTAS		DAKRKRGRPR		KKSGGSGERN		STPLKSAAAM		ESAQSSRLPW
ETWGSGGEGN		SAGGAERPGP		MGEAEKGAVL		AQGQGDGTVS		KGGRGPGSQH
TKEAEDKIPL		VPSKVSVIKG		SRSQKEAFPL		AKGEVDTAPQ		GNKDLKEHVL
QSSLSQEHKD		PKATPP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Laird K.M., Briggs L.L., Boss J.M., Summers M.F., Garvie C.W. (2010). Solution structure of the heterotrimeric complex between the interaction domains of RFX5 and RFXAP from the RFX gene regulatory complex. J. Mol. Biol. 403: 40—51. PMID 20732328 doi:10.1016/j.jmb.2010.08.025
• Nekrep N., Jabrane-Ferrat N., Peterlin B.M. (2000). Mutations in the bare lymphocyte syndrome define critical steps in the assembly of the regulatory factor X complex. Mol. Cell. Biol. 20: 4455—4461. PMID 10825209 doi:10.1128/MCB.20.12.4455-4461.2000

Див. також

• Хромосома 1