Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
SOX11
Ідентифікатори
Символи
SOX11 , MRD27, SRY-box 11, CSS9, SRY-box transcription factor 11
Зовнішні ІД
OMIM : 600898 MGI: 98359 HomoloGene: 37733 GeneCards: SOX11
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 27 [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • translation factor activity, RNA binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• embryonic skeletal system morphogenesis • skeletal system development • noradrenergic neuron differentiation • positive regulation of lens epithelial cell proliferation • диференціація клітин • cardiac ventricle formation • glial cell development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • limb bud formation • lung morphogenesis • sympathetic nervous system development • neural crest cell development • розвиток нирки • negative regulation of glial cell proliferation • soft palate development • ventricular septum morphogenesis • cornea development in camera-type eye • outflow tract morphogenesis • positive regulation of ossification • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell death • transcription by RNA polymerase II • eyelid development in camera-type eye • negative regulation of gene expression • negative regulation of lymphocyte proliferation • somite development • transcription, DNA-templated • neuroepithelial cell differentiation • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of hippo signaling • positive regulation of neurogenesis • multicellular organism development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of osteoblast differentiation • lens morphogenesis in camera-type eye • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • hard palate development • positive regulation of neuron differentiation • neuron differentiation • positive regulation of cell population proliferation • spinal cord development • positive regulation of BMP signaling pathway • glial cell proliferation • skeletal muscle cell differentiation • embryonic digestive tract morphogenesis • oligodendrocyte development • проліферація • positive regulation of stem cell proliferation • neural tube formation • positive regulation of hormone secretion • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • closure of optic fissure • Біосинтез білків
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 5.69 – 5.7 Mb
Хр. 12: 27.38 – 27.39 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
SOX11 (англ. SRY-box 11 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот , а молекулярна маса — 46 679[ 5] .
Послідовність амінокислот
10
20
30
40
50
MVQQAESLEA
ESNLPREALD
TEEGEFMACS
PVALDESDPD
WCKTASGHIK
RPMNAFMVWS
KIERRKIMEQ
SPDMHNAEIS
KRLGKRWKML
KDSEKIPFIR
EAERLRLKHM
ADYPDYKYRP
RKKPKMDPSA
KPSASQSPEK
SAAGGGGGSA
GGGAGGAKTS
KGSSKKCGKL
KAPAAAGAKA
GAGKAAQSGD
YGGAGDDYVL
GSLRVSGSGG
GGAGKTVKCV
FLDEDDDDDD
DDDELQLQIK
QEPDEEDEEP
PHQQLLQPPG
QQPSQLLRRY
NVAKVPASPT
LSSSAESPEG
ASLYDEVRAG
ATSGAGGGSR
LYYSFKNITK
QHPPPLAQPA
LSPASSRSVS
TSSSSSSGSS
SGSSGEDADD
LMFDLSLNFS
QSAHSASEQQ
LGGGAAAGNL
SLSLVDKDLD
SFSEGSLGSH
FEFPDYCTPE
LSEMIAGDWL
EANFSDLVFT
Y
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, нейрогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші