SEMA4D

SEMA4D
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OLZ, 3OL2
Ідентифікатори
Символи	SEMA4D, C9orf164, CD100, M-sema-G, SEMAJ, coll-4, semaphorin 4D, COLL4, A8, GR3, BB18
Зовнішні ІД	OMIM: 601866 MGI: 109244 HomoloGene: 21282 GeneCards: SEMA4D
Онтологія гена Молекулярна функція • signaling receptor binding • transmembrane signaling receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • semaphorin receptor binding • neuropilin binding • identical protein binding • signaling receptor activity • chemorepellent activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана • міжклітинний простір Біологічний процес • regulation of dendrite morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • multicellular organism development • leukocyte aggregation • нейробіологія розвитку • negative regulation of cell adhesion • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • positive regulation of axonogenesis • semaphorin-plexin signaling pathway involved in bone trabecula morphogenesis • regulation of cell projection organization • negative regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of collateral sprouting • regulation of cell shape • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • диференціація клітин • positive regulation of protein phosphorylation • semaphorin-plexin signaling pathway • адгезія клітин • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • ossification involved in bone maturation • positive regulation of cell migration • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of alkaline phosphatase activity • negative chemotaxis • neural crest cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • positive regulation of inhibitory synapse assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10507	20354
Ensembl	ENSG00000187764	ENSMUSG00000021451
UniProt	Q92854	O09126
RefSeq (мРНК)	NM_001142287 NM_006378 NM_182635 NM_001371194 NM_001371195 NM_001371196 NM_001371197 NM_001371198 NM_001371199 NM_001371200 NM_001371201 NM_001371202	NM_001281880 NM_013660
RefSeq (білок)	NP_001135759 NP_006369 NP_001358123 NP_001358124 NP_001358125 NP_001358126 NP_001358127 NP_001358128 NP_001358129 NP_001358130 NP_001358131	NP_001268809 NP_038688 NP_001365242 NP_001365243 NP_001365246 NP_001365247 NP_001365248 NP_001365249 NP_001365251 NP_001365252 NP_001365253 NP_001365244 NP_001365245 NP_001365250 NP_001365254
Локус (UCSC)	Хр. 9: 89.36 – 89.5 Mb	Хр. 13: 51.69 – 51.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEMA4D (англ. Semaphorin 4D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 96 150.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRMCTPIRGL		LMALAVMFGT		AMAFAPIPRI		TWEHREVHLV		QFHEPDIYNY
SALLLSEDKD		TLYIGAREAV		FAVNALNISE		KQHEVYWKVS		EDKKAKCAEK
GKSKQTECLN		YIRVLQPLSA		TSLYVCGTNA		FQPACDHLNL		TSFKFLGKNE
DGKGRCPFDP		AHSYTSVMVD		GELYSGTSYN		FLGSEPIISR		NSSHSPLRTE
YAIPWLNEPS		FVFADVIRKS		PDSPDGEDDR		VYFFFTEVSV		EYEFVFRVLI
PRIARVCKGD		QGGLRTLQKK		WTSFLKARLI		CSRPDSGLVF		NVLRDVFVLR
SPGLKVPVFY		ALFTPQLNNV		GLSAVCAYNL		STAEEVFSHG		KYMQSTTVEQ
SHTKWVRYNG		PVPKPRPGAC		IDSEARAANY		TSSLNLPDKT		LQFVKDHPLM
DDSVTPIDNR		PRLIKKDVNY		TQIVVDRTQA		LDGTVYDVMF		VSTDRGALHK
AISLEHAVHI		IEETQLFQDF		EPVQTLLLSS		KKGNRFVYAG		SNSGVVQAPL
AFCGKHGTCE		DCVLARDPYC		AWSPPTATCV		ALHQTESPSR		GLIQEMSGDA
SVCPDKSKGS		YRQHFFKHGG		TAELKCSQKS		NLARVFWKFQ		NGVLKAESPK
YGLMGRKNLL		IFNLSEGDSG		VYQCLSEERV		KNKTVFQVVA		KHVLEVKVVP
KPVVAPTLSV		VQTEGSRIAT		KVLVASTQGS		SPPTPAVQAT		SSGAITLPPK
PAPTGTSCEP		KIVINTVPQL		HSEKTMYLKS		SDNRLLMSLF		LFFFVLFLCL
FFYNCYKGYL		PRQCLKFRSA		LLIGKKKPKS		DFCDREQSLK		ETLVEPGSFS
QQNGEHPKPA		LDTGYETEQD		TITSKVPTDR		EDSQRIDDLS		ARDKPFDVKC
ELKFADSDAD		GD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Basile J.R., Afkhami T., Gutkind J.S. (2005). Semaphorin 4D/plexin-B1 induces endothelial cell migration through the activation of PYK2, Src, and the phosphatidylinositol 3-kinase-Akt pathway. Mol. Cell. Biol. 25: 6889—6898. PMID 16055703 doi:10.1128/MCB.25.16.6889-6898.2005
• Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 doi:10.1074/mcp.M500324-MCP200

Див. також

• Хромосома 9