CCR6

CCR6
Ідентифікатори
Символи	CCR6, BN-1, C-C CKR-6, CC-CKR-6, CCR-6, CD196, CKR-L3, CKRL3, CMKBR6, DCR2, DRY6, GPR29, GPRCY4, STRL22, C-C motif chemokine receptor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 601835 MGI: 1333797 HomoloGene: 3214 GeneCards: CCR6
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит
Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity; • signal transducer activity; • chemokine receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • C-C chemokine receptor activity; • C-C chemokine binding; • signaling receptor activity; • chemokine binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • внутрішньоклітинний; • cell surface; • sperm midpiece; • sperm flagellum; • sperm principal piece; • sperm plasma membrane; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • positive regulation of epithelial cell migration; • dendritic cell chemotaxis; • cellular defense response; • humoral immune response; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • positive regulation of dendritic cell chemotaxis; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • calcium-mediated signaling; • хемотаксис; • cell chemotaxis; • chemokine-mediated signaling pathway; • leukocyte migration involved in inflammatory response; • isotype switching to IgA isotypes; • positive regulation of flagellated sperm motility involved in capacitation; • lymphocyte migration; • T cell migration; • thymocyte migration; • DN2 thymocyte differentiation; • DN3 thymocyte differentiation; • regulation of T cell migration; • G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1235
	12458
	ENSG00000112486
	ENSMUSG00000040899
	P51684
	O54689
	NM_031409; NM_004367; NM_001394582
NM_001190333; NM_001190334; NM_001190335; NM_001190336; NM_001190337;
	NM_001190338; NM_009835
	NP_004358; NP_113597
NP_001177262; NP_001177263; NP_001177264; NP_001177265; NP_001177266;
	NP_001177267; NP_033965
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CCR6 (англ. C-C motif chemokine receptor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 374 амінокислот, а молекулярна маса — 42 494^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGESMNFSD	VFDSSEDYFV	SVNTSYYSVD	SEMLLCSLQE	VRQFSRLFVP
IAYSLICVFG	LLGNILVVIT	FAFYKKARSM	TDVYLLNMAI	ADILFVLTLP
FWAVSHATGA	WVFSNATCKL	LKGIYAINFN	CGMLLLTCIS	MDRYIAIVQA
TKSFRLRSRT	LPRSKIICLV	VWGLSVIISS	STFVFNQKYN	TQGSDVCEPK
YQTVSEPIRW	KLLMLGLELL	FGFFIPLMFM	IFCYTFIVKT	LVQAQNSKRH
KAIRVIIAVV	LVFLACQIPH	NMVLLVTAAN	LGKMNRSCQS	EKLIGYTKTV
TEVLAFLHCC	LNPVLYAFIG	QKFRNYFLKI	LKDLWCVRRK	YKSSGFSCAG
RYSENISRQT	SETADNDNAS	SFTM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Zaballos A., Varona R., Gutierrez J., Lind P., Marquez G. (1996). Molecular cloning and RNA expression of two new human chemokine receptor-like genes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 227: 846—853. PMID 8886020 doi:10.1006/bbrc.1996.1595
Liao F., Lee H.-H., Farber J.M. (1997). Cloning of STRL22, a new human gene encoding a G-protein-coupled receptor related to chemokine receptors and located on chromosome 6q27. Genomics. 40: 175—180. PMID 9070937 doi:10.1006/geno.1996.4544
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Ai L.S., Liao F. (2002). Mutating the four extracellular cysteines in the chemokine receptor CCR6 reveals their differing roles in receptor trafficking, ligand binding, and signaling. Biochemistry. 41: 8332—8341. PMID 12081481 doi:10.1021/bi025855y
Roehrl J., Yang D., Oppenheim J.J., Hehlgans T. (2010). Specific binding and chemotactic activity of mBD4 and its functional orthologue hBD2 to CCR6-expressing cells. J. Biol. Chem. 285: 7028—7034. PMID 20068036 doi:10.1074/jbc.M109.091090
Ito T., Carson W.F. IV, Cavassani K.A., Connett J.M., Kunkel S.L. (2011). CCR6 as a mediator of immunity in the lung and gut. Exp. Cell Res. 317: 613—619. PMID 21376174 doi:10.1016/j.yexcr.2010.12.018

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CCR6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1607 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-06 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P51684 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CCR6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1607 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-06 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P51684 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350