Перейти до вмісту

ITGA5

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ITGA5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ITGA5, CD49e, FNRA, VLA5A, VLA-5, integrin subunit alpha 5
Зовнішні ІД OMIM: 135620 MGI: 96604 HomoloGene: 20508 GeneCards: ITGA5
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_002205
NM_010577
NM_001314041
RefSeq (білок)
NP_002196
NP_001300970
NP_034707
Локус (UCSC) Хр. 12: 54.4 – 54.42 Mb Хр. 15: 103.25 – 103.28 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGA5 (англ. Integrin subunit alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 049 амінокислот, а молекулярна маса — 114 536[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGSRTPESPL HAVQLRWGPR RRPPLLPLLL LLLPPPPRVG GFNLDAEAPA
VLSGPPGSFF GFSVEFYRPG TDGVSVLVGA PKANTSQPGV LQGGAVYLCP
WGASPTQCTP IEFDSKGSRL LESSLSSSEG EEPVEYKSLQ WFGATVRAHG
SSILACAPLY SWRTEKEPLS DPVGTCYLST DNFTRILEYA PCRSDFSWAA
GQGYCQGGFS AEFTKTGRVV LGGPGSYFWQ GQILSATQEQ IAESYYPEYL
INLVQGQLQT RQASSIYDDS YLGYSVAVGE FSGDDTEDFV AGVPKGNLTY
GYVTILNGSD IRSLYNFSGE QMASYFGYAV AATDVNGDGL DDLLVGAPLL
MDRTPDGRPQ EVGRVYVYLQ HPAGIEPTPT LTLTGHDEFG RFGSSLTPLG
DLDQDGYNDV AIGAPFGGET QQGVVFVFPG GPGGLGSKPS QVLQPLWAAS
HTPDFFGSAL RGGRDLDGNG YPDLIVGSFG VDKAVVYRGR PIVSASASLT
IFPAMFNPEE RSCSLEGNPV ACINLSFCLN ASGKHVADSI GFTVELQLDW
QKQKGGVRRA LFLASRQATL TQTLLIQNGA REDCREMKIY LRNESEFRDK
LSPIHIALNF SLDPQAPVDS HGLRPALHYQ SKSRIEDKAQ ILLDCGEDNI
CVPDLQLEVF GEQNHVYLGD KNALNLTFHA QNVGEGGAYE AELRVTAPPE
AEYSGLVRHP GNFSSLSCDY FAVNQSRLLV CDLGNPMKAG ASLWGGLRFT
VPHLRDTKKT IQFDFQILSK NLNNSQSDVV SFRLSVEAQA QVTLNGVSKP
EAVLFPVSDW HPRDQPQKEE DLGPAVHHVY ELINQGPSSI SQGVLELSCP
QALEGQQLLY VTRVTGLNCT TNHPINPKGL ELDPEGSLHH QQKREAPSRS
SASSGPQILK CPEAECFRLR CELGPLHQQE SQSLQLHFRV WAKTFLQREH
QPFSLQCEAV YKALKMPYRI LPRQLPQKER QVATAVQWTK AEGSYGVPLW
IIILAILFGL LLLGLLIYIL YKLGFFKRSL PYGTAMEKAQ LKPPATSDA

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Takada Y., Strominger J.L., Hemler M.E. (1987). The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3239—3243. PMID 3033641 doi:10.1073/pnas.84.10.3239
  • Sano H., Liu S.C.H., Lane W.S., Piletz J.E., Lienhard G.E. (2002). Insulin receptor substrate 4 associates with the protein IRAS. J. Biol. Chem. 277: 19439—19447. PMID 11912194 doi:10.1074/jbc.M111838200
  • Weigel-Kelley K.A., Yoder M.C., Srivastava A. (2003). Alpha5beta1 integrin as a cellular coreceptor for human parvovirus B19: requirement of functional activation of beta1 integrin for viral entry. Blood. 102: 3927—3933. PMID 12907437 doi:10.1182/blood-2003-05-1522
  • Chen F.-H., Thomas A.O., Hecht J.T., Goldring M.B., Lawler J. (2005). Cartilage oligomeric matrix protein/thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins. J. Biol. Chem. 280: 32655—32661. PMID 16051604 doi:10.1074/jbc.M504778200
  • Paule S., Aljofan M., Simon C., Rombauts L.J., Nie G. (2012). Cleavage of endometrial alpha-integrins into their functional forms is mediated by proprotein convertase 5/6. Hum. Reprod. 27: 2766—2774. PMID 22740495 doi:10.1093/humrep/des203

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6141 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P08648 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]