Der Verein wurde ursprünglich als Turnverein gegründet. Die in den 1920er Jahren dazugekommene Fußballabteilung blieb sportlich jahrzehntelang nur auf Würzburger Kreisebene aktiv. 2002 wurde der ehemalige Bundesligaspieler Martin Schneider als Spielertrainer verpflichtet, als sein Assistent kam der ehemalige Nürnberger Profispieler Jörg Dittwar. Der sportliche Erfolg in der Bayernliga blieb aus und der Verein belegte in der Abschlusstabelle 2003 den letzten Platz. Erfolgreicher schnitt der TSV Gerbrunn im Bayerischen Toto-Pokal ab: mit dem Einzug ins Finale qualifizierte er sich für die 1.Runde um den DFB-Pokal 2003/04.
Der Bayernliga-Kader verließ den Verein und als Spieler standen nur die der 2.Mannschaft in der Kreisklasse zur Verfügung. Der neue Vereinsvorsitzende Günther Brückner entschied, die nicht konkurrenzfähige Mannschaft aus der Landesliga zurückzuziehen und in der Kreisklasse einen Neuaufbau einzuleiten.
Am 18.Juli 2003 bestritt dieses Kreisklassenteam gegen den TSV Aindling das Finale um den Bayerischen Toto-Pokal und unterlag mit 0:14. Sechs Wochen später trat der nunmalige Neuntligist als klassentiefster Verein in der Geschichte des DFB-Pokals in der 1.Runde gegen den Zweitligisten SV Wacker Burghausen an und unterlag ebenfalls mit 0:14, die damals zweithöchste Niederlage in der Geschichte des Pokals.[1]