Der Stapelager Berg erhebt sich im Nordwesten der Stapelager Berge im Naturpark Teutoburger Wald/Eggegebirge. Sein Gipfel liegt 7,6km südwestlich der Kernstadt von Lage, 2,2km südwestlich des Lager Stadtteils Hörste, in dessen Gemarkung sich der Berg befindet, 3,2km nordnordwestlich der Gemeinde Augustdorf und 5,4km nordöstlich von Stukenbrock, einem Stadtteil von Schloß Holte-Stukenbrock.
Zu den Fließgewässern am Stapelager Berg gehören der Massiekbach, einem Zufluss des auf dem Nordhang entspringenden Stapelager Bachs, der den vom Nordosthang quellenden Hörster Bach speist; Letzterer mündet in den ebenso Hörster Bach genannten Zufluss des Rethlager Bachs. Etwas südwestlich des Berges entspringt beim jenseits vom Standortübungsplatz Stapel des Truppenübungsplatzes Senne gelegenen Heidehaus der Ölbach.
Der Stapelager Berg gehört in der naturräumlichen Haupteinheitengruppe Unteres Weserbergland (Nr.53), in der Haupteinheit Bielefelder Osning (530) und in der Untereinheit Osning-Kamm (530.1) zum Naturraum Brackweder Osning (530.11). Die Landschaft fällt nach Nordosten in die Untereinheit Werther-Oerlinghausener Osning-Vorberge (530.0) in den Naturraum Bielefelder Berge (530.01) ab. Nach Südwesten leitet sie in den Naturraum Wistinghäuser Senne (540.01) über, der in der Haupteinheitengruppe Westfälische Bucht (54) und in der Haupteinheit Ostmünsterland (540) zur Untereinheit Senne (540.0) zählt.[2]
Auf dem Stapelager Berg liegen Teile des NaturschutzgebietsÖstlicher Teutoburger Wald (CDDA-Nr.329562; 2004 ausgewiesen; 23,1953km² groß), des Fauna-Flora-Habitat-Gebiets Östlicher Teutoburger Wald (FFH-Nr.4017-301; 53,0359km²) und des VogelschutzgebietsSenne mit Teutoburger Wald (VSG-Nr.4118-401; 153,5968km²). Bis auf den unteren Bereich der Nordflanke und an den Westfuß reichen Teile des LandschaftsschutzgebietsTeutoburger Wald mit Lippischem Wald, Osning-Kamm und östlichem Osning-Vorland (CDDA-Nr.555553234; 2006; 14,5165km²).[3]