Pseudomonadati
| Pseudomonadati | ||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||
| Pseudomonadati | ||||||
| (Gibbons & Murray 1978) Oren & Göker 2024[1] |
Pseudomonadati ist ein 2024 aufgestelltes Bakterien-Reich,[1] das etwa ein Drittel aller bekannten Arten von Prokaryoten (Bakterien und Archaeen) umfasst (Stand 2009[A. 1]). Es umfasst hauptsächlich gramnegative Bakterien und deren Verwandte.[2] Es galt (auf seiner Ebene) als der nächste Verwandte eines noch größeren Reiches der Bakterien, der Bacillati, bei denen es sich überwiegend um grampositive Bakterien handelt[3][2] (seit der Ausgliederung des kleinere Reichs Thermotogati aus den Bacillati gilt das so nicht mehr).
Benennung und Namensherkunft
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Der Name des Taxons, Pseudomonadati, ist neulateinisch und zusammengesetzt aus den Namen der Typusgattung Pseudomonas, sowie der Plural-Endung ‚-ati‘, die Prokaryoten-Reiche kennzeichnet. Der Name bezeichnet also das Reich der Gattung Pseudomonas. Dieser Gattungsname Pseudomonas selbst setzt sich zusammen aus dem Präfix altgriechisch ψευδο- pseudo- (‚so wie‘, ‚scheinbar‘) von ψευδής pseudês, deutsch ‚falsch‘ bzw. ψεῦδος pseúdos, deutsch ‚Täuschung‘, und lateinisch monas ‚Monade‘, ‚Einheit‘ (‚Einzeller‘). Die Gattung wurde zuerst von Walter Migula Ende des 19. Jahrhunderts identifiziert und er wollte sie damit möglicherweise als nicht wirkliche Mitglieder der Protisten-Gattung Monas begeißelter nanogroßer Goldbrauner Algen kennzeichnen.[4][1]
Die heutige Bezeichnung Pseudomonadati ist der offizielle Name für eine bereits 1978 von Gibbons und Murray umschriebene Klade[1][5] „Gracilicutes“ und umfasst das 2012 von Luketa vorgeschlagene Superphylum „Hydrobacterida“ [„Hydrobacteria“, deutsch Hydrobakterien], ergänzt um das von ihm gleichzeitig vorgeschlagene Superphylum „Aquificida“ [„Aquificae“].[1][5][6] Die beiden Namen leiten sich ab von der altgriechisch bzw. lateinischen Bezeichnung für Wasser (altgriechisch ὕδωρ hydōr, deutsch ‚Wasser‘, als Präfix hydro-, respektive lateinisch aqua ‚Wasser‘) und beziehen sich auf die feuchte Umgebung, die für den gemeinsamen Vorfahren dieser Arten angenommen wird.[A. 2][3][2] Auf heutiger Ebene der Reiche (als offizielle Rangstufe anstelle des informellen ‚Superphylum‘) sind daher beide Bezeichnungen von Luketa Juniorsynonyme des seit 2024 nach dem International Code of Nomenclature of Prokaryotes (einzig) gültig veröffentlichten und damit offiziellen Namens Pseudomonadati.[1][7]
Das 1978 von Gibbons und Murray beschriebene Taxon „Gracilicutes“ wurde oder wird noch manchmal anstelle der modernen Bezeichnung Pseudomonadati verwendet.[8] Allerdings umfasste „Gracilicutes“ auch die zum Reich Bacillati gehörenden Cyanobakterien. Zudem wurde dieser Name nicht nach dem heute allgemein anerkannten Drei-Domänen-System (Bakterien, Archaeen, Eukaryoten) konstruiert.[8] Im Jahr 2006 wurde von Thomas Cavalier-Smith eine Neudefinition von „Gracilicutes“ vorgeschlagen, die jedoch keine molekulare Phylogenie oder statistische Analysen umfasste. Zudem folgte sie ebenfalls nicht dem Drei-Domänen-System, da eine Abstammungslinie der Klade aus Eukaryoten und Archaeen als innerhalb der Bakterien entspringend mit dem Phylum Actinomycetota als engen Verwandten vorausgesetzt wurde[9] – ein Stammbaum, der in molekularen Phylogenie nirgends unterstützt wird.
Systematik
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Nach Gareth A. Coleman et al. (2021) und Raphaël R. Léonard et al. gehören zum Reich Pseudomonadati folgende Phyla und Superphyla[10][11] (mit heutigen Bezeichnungen):[1][5] FCB-Superphylum, PVC-Superphylum, Acidobacteriota, Aquificota, Bdellovibrionota,[A. 3] Campylobacterota [„Epsilonbacteraeota“],[A. 4] Deferribacterota,[A. 5] Thermodesulfobacteriota,[A. 6] Elusimicrobiota, Myxococcota,[A. 7] Nitrospirota, Pseudomonadota,[A. 8] Spirochaetota.
Im Detail ist die derzeit (Stand 20. Januar 2026) akzeptierte Taxonomie, basierend auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[1] und dem National Center for Biotechnology Information (NCBI),[5] ergänzt um Einträge aus der Genome Taxonomy Database (GTDB),[12] wie folgt:
Reich Pseudomonadati (Gibbons & Murray 1978) Oren & Göker 2024(L,N)
„Aquificida“ Luketa 2012(L),
„Hydrobacterida“ Luketa 2012[6](L), …] (Proteobakterien s. l.)
- Phylum Abditibacteriota Tahon et al. 2023(L,N) [„Abditibacteriota“ Tahon et al. 2018(L,N), Candidate division FBP(N), FBP group]
– in der GTDB zu Armatimonadota(G) (dieses Phylum gehört aber lt. LPSN und NCBI-Taxonomie zum Reich Bacillati)
- Phylum Acidobacteriota Thrash & Coates 2021(L,G)[12.1] bzw. corrig. Thrash & Coates 2021(N) [„Acidobacteriota“ Whitman et al. 2018(L), „Acidobacteraeota“ Oren et al. 2015(L), „Candidatus Aminicenantota“ corrig. Rinke et al. 2013(L), „Acidobacteria“ Thrash & Coates 2010(L) bzw. 2012(N) (s. l.), „Ca. Aminicenantes“ Rinke et al. 2013(L) (s. l.)]
- Phylum Aquificota Reysenbach 2021(L,G)[12.2] bzw. corrig. Reysenbach 2021(N) [„Aquificota“ Whitman et al. 2018(L), „Aquificaeota“ Oren et al. 2015(L,N), „Aquithermota“ Cavalier-Smith 2020(L), Thermosulfidibacterota Chuvochina 2024(L), „Thermosulfidibacterota“ Montecillo 2024(L) bzw. Chuvochina 2023(N), „Aquificae“ Reysenbach 2001(L,N) (s. l.), „Hydrobacteria“ Battistuzzi & Hedges 2009[2] (s. l.)]
– Thermosulfidibacterota ist in der NCBI-Taxonomie kein Synonym, sondern eigenes Phylum(N)
– mit Aquificales (Aquifex, Persephonella, Hydrogenivirga, …)
- Phylum Atribacterota Katayama et al. 2021(L,N,G) [„Atribacterota“ Katayama et al. 2020(L,N), „Candidatus Caldatribacteriota“ Hahn et al. 2020(L), „Ca. Atribacteria“ Dodsworth et al. 2013(L,N) (s. l.)]
- Phylum Caldisericota Mori et al. 2021(L,G)[12.3] bzw. corrig. Mori et al. 2021(N) [„Caldisericota“ Whitman et al. 2018(L,N), „Caldisericaeota“ Oren et al. 2015(L,N), „Caldiserica“ Mori et al. 2009(L,N) (s. l.)]
– mit Caldisericum, Coprothermobacter, Thermodesulfobium
- Phylum Calditrichota Kublanov et al. 2021(L,G)[12.4] [„Calditrichota“ Youssef et al. 2019(L), „Calditrichaeota“ Kublanov et al. 2017(L)]
- Phylum Chrysiogenota Garrity & Holt 2021(L,G)[12.5] [„Chrysiogenetota“ Whitman et al. 2018(L), „Chrysiogenaeota“ Oren et al. 2015(L), „Chrysiogenetes“ Garrity & Holt 2001(L) (s. l.), „Ignavibacteriae“ Podosokorskaya et al. 2013(L) (s. l.)]
- Phylum Coprothermobacterota Pavan et al. 2021(L,N,G)[12.6] [„Coprothermobacterota“ Pavan et al. 2018(L,N)]
- Phylum „Candidatus Cryosericota“ Martinez et al. 2019(N)
– in der LPSN Bakterien incertae sedis(L), in der GTDB zu Caldisericota(G)
- Phylum Deferribacterota Garrity & Holt 2021(L) bzw. corrig. Garrity & Holt 2021(N) [„Deferribacterota“ Whitman et al. 2018(L,N), „Deferribacteraeota“ Oren et al. 2015(L,N), „Deferribacteres“ Garrity & Holt 2001(L) (s. l.)]
– in der GTDB zu Chrysiogenota(G)
- Phylum Dictyoglomerota corrig. Patel 2021(L) [„Dictyoglomerota“ corrig. Whitman et al. 2018(L), Dictyoglomota Patel 2021(L,G)[12.7], „Dictyoglomota“ Whitman et al. 2018(L), „Dictyoglomaeota“ Oren et al. 2015(L), „Dictyoglomera“ corrig. Patel 2010(L) (s. l.), „Dictyoglomi“ Patel 2010(L) (s. l.)]
– mit Dictyoglomus
- Phylum Elusimicrobiota Geissinger et al. 2021(L,G)[12.8] [ „Elusimicrobiota“ Whitman et al. 2018(L), „Elusimicrobaeota“ Oren et al. 2015(L), „Elusimicrobia“ Geissinger et al. 2009(L) (s. l.)]
– mit Elsusimicrobium
- Phylum Nitrospinota Lücker et al. 2021(L,G)[12.9] [„Nitrospinae“ Lücker et al. 2013(L) (s. l.)]
- Phylum Nitrospirota Garrity & Holt 2021(L,G)[12.10] bzw. corrig. Garrity & Holt 2021(N) [„Nitrospirota“ Whitman et al. 2018(L), „Nitrospiraeota“ Oren et al. 2015(L,N), „Nitrospirae“ Garrity & Holt 2001(L,N) (s. l.)] (Thermodesulfovibrio-Nitrospira-Gruppe)
– in der GTDB Abspaltungen Nitrosptota_A und Nitrospirota_B(G)
- Phylum Pseudomonadota Garrity et al. 2021(L,G)[12.11] bzw. corrig. Garrity et al. 2021(N) [„Proteobacteriota“Panda et al. 2021(L,N),Bdellovibrionota Waite et al. 2022(N), „Bdellovibrionota“ Waite et al. 2020(L), Campylobacterota Waite et al. 2021(L), „Campylobacterota“ Waite et al. 2018(L), Myxococcota Waite et al. 2021(L), „Myxococcota“ Waite et al. 2020(L), „Epsilonbacteraeota“ Waite et al. 2017(L), Proteobacteria Stackebrandt et al. 1988, nom. illeg.(N), „Proteobacteria“ Gray & Herwig 1996(L) bzw. Garrity et al. 2005(L,N) (s. l.)] (photosynthetische Purpubakterien und Verwandte(N)) – in der NCBI-Taxonomie ist Bdellovibrionota kein Synonym, sondern eigenes Phylum, ebenso Campylobacterota alias „Epsilonbacteraeota“ und Myxococcota(N)
- Phylum Spirochaetota Garrity & Holt 2021(L,G)[12.12] bzw. corrig. Garrity & Holt 2021(N) [„Spirochaetota“ Whitman et al. 2018(L), „Spirochaetaeota“ Oren et al. 2015(L,N), „Spirochaetes“ Garrity & Holt 2001(L,N) (s. l.), „Spirochaetae“ (Ehrenberg 1855) Cavalier-Smith 1998(L) (s. l.)] (Spirochäten)
– mit Spirochaeta
- Phylum Thermodesulfobacteriota Garrity & Holt 2021(L) bzw. corrig. Garrity & Holt 2021(N) [„Thermodesulfobacteriota“ Whitman et al. 2018(N), „Thermodesulfobacteraeota“ Oren et al. 2015(L,N), Desulfobacterota Waite et al. 2023(L,N,G)[12.13], „Desulfobacterota“ Waite et al. 2020(L), „Desulfovibrionota“ corrig. Soltysova et al. 2025(L), „Desulfovibriota“ Soltysova et al. 2025(L), „Deferrisomatota“ Murphy et al. 2021(L), „Thermodesulfobacteria“ Garrity & Holt 2001(L) (s. l.)]
– mit Thermodesulfatator
- Phylum Thermomicrobiota Garrity & Holt 2021(L) bzw. corrig. Garrity & Holt 2021(N) [„Thermomicrobiota“ Whitman et al. 2018(L), „Thermomicrobaeota“ Oren et al. 2015(L), „Thermomicrobia“ Garrity & Holt 2001(L,G) (s. l.)] – in der GTDB zu Chloroflexota(G)
- Phylum „Candidatus Zhurongbacterota“ Leng et al. 2023(L,N) [„Zhurongbacterota“ Leng et al. 2023(N)]
– in der GTDB zu Coprothermobacterota(G)
| | Zur FCB-Gruppe (s. l.) innerhalb der Pseudomonadati gehören folgende Phyla:(N) |
- Phylum Bacteroidota Krieg et al. 2021(L,G) [„Bacteroidota“ Whitman et al. 2018(L), „Bacteroidaeota“ Oren et al. 2015(L), „Bacteroidetes“ Krieg et al. 2010(L) (s. l.)]
- Phylum Balneolota Hahnke et al. 2021(L) [ „Balneolota“ García-López et al. 2019(L), „Balneolaeota“ Hahnke et al. 2016(L)]
– in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien)
- Phylum Chlorobiota Iino et al. 2021(L) „Chlorobiota“ Whitman et al. 2018(L), „Chlorobaeota“ Oren et al. 2015(L), Ignavibacteriota Podosokorskaya et al. 2021(L), „Ignavibacteriota“ Whitman et al. 2018(L), „Ignavibacteraeota“ Oren et al. 2015(L), [„Ignavibacteriae“ Podosokorskaya et al. 2013(L), „Chlorobi“ Garrity & Holt 2001(L) bzw. Iino et al. 2010(L) (s. l.), Bacteroidota_A(G)] (Grüne Schwefelbakterien)
in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien); in der NCBI-Taxonomie ist Ignavibacteriota eigenes Phylum, nicht synonym(N)
- Phylum „Candidatus Cloacimonadota“ corrig. Rinke et al. 2013(L,G)[12.14] [„Ca. Cloacimonetes“ Rinke et al. 2013(L) (s. l.)]
- Phylum „Candidatus Electryoneota“ Williams et al. 2022(L,N,G)[12.15] [„Ca. Debefiota“ Pallen et al. 2022(N), Candidate division LCP-89(N)[A. 9]]
– in der LPSN Bakterien incertae sedis(L)
- Phylum „Candidatus Fermentibacterota“ Kirkegaard et al. 2016(L,G)[12.16] bzw. corrig. Kirkegaard et al. 2016(N) [„Ca. Fermentibacteria“ Kirkegaard et al. 2016(L,N) (s. l.), Candidate division Hyd24-12(N)]
– in der LPSN Bakterien incertae sedis(L), in der GTDB inkl. Gattung „Ca. Aegiribacteria“ (sic!)(G) (diese in der NCBI-Taxonomie zur FCB-Gruppe incertae sedis, in der LPSN Bakterien incertae sedis(L))
- Phylum Fibrobacterota Garrity & Holt 2021(L,G)[12.17] [„Fibrobacterota“ Whitman et al. 2018(L), „Fibrobacteraeota“ Oren et al. 2015(L), „Fibrobacteres“ Garrity & Holt 2001(L) (s. l.)]
- Phylum Fidelibacterota Katayama et al. 2024(L,N)[A. 10] [„Ca. Neomarinimicrobiota“ corrig. Rinke et al. 2013(N)[A. 10],„Ca. Marinisomatota“ Royalty & Steen 2019(L,N,G)[12.18][A. 11](L,G), Marine Group A(N), SAR406 Cluster(N)][A. 12]
- Phylum Gemmatimonadota Zhang et al. 2021(L,G)[12.20] [„Gemmatimonadota“ Whitman et al. 2018(L), „Gemmatimonadaeota“ Oren et al. 2015(L), „Gemmatimonadetes“ Zhang et al. 2003(L) (s. l.)]
- Phylum „Candidatus Hydrogenedentota“ corrig. Rinke et al. 2015(L,N,G)[12.21] [„Ca. Hydrogenedentes“ Rinke et al. 2013(L,N) (s. l.)]
– in der LPSN Bakterien incertae sedis(L)
- Phylum „Candidatus Kapaibacteriota“ corrig. Kantor et al. 2015(L) bzw. Kantor et al. 2015(N)
– in der LPSN Bakterien incertae sedis(L), in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien)
- Phylum „Candidatus Kryptoniota“ corrig. Eloe-Fadrosh et al. 2016(L) [„Ca. Kryptonia“ Eloe-Fadrosh et al. 2016(L) (s. l.)]
– in der LPSN Bakterien incertae sedis(L), in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien)
- Phylum „Candidatus Latescibacterota“ corrig. Rinke et al. 2013(L,G)[12.22] [„Ca. Latescibacteria“ Rinke et al. 2013(L) (s. l.)]
- Phylum Rhodothermota Munoz et al. 2021(L) [„Rhodothermota“ García-López et al. 2019(L), „Rhodothermaeota“ Munoz et al. 2016(L)] (Rhodothermaceae etc.)
– in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien)
- Phylum „Candidatus Zhuqueibacterota“ Lian et al. 2024(L,N,G)[12.23]
- Phylum „Candidatus Zixiibacteriota“ corrig. Castelle et al. 2013(L,N) [„Ca. Zixibacteria“" Castelle et al. 2013(L,N,G) (s. l.)[12.24]]
– verwaister Eintrag in der LPSN(L)
| | Zur PVC-Gruppe innerhalb der Pseudomonadati gehören folgende Phyla:(N) |
- Phylum „Candidatus Auribacterota“ Momper et al. 2017(L,N,G)[12.25] [„Ca. Aureabacteria“ Momper et al. 2017(N) (s. l.)]
– in der LPSN Bakterien incertae sedis(L)
- Phylum Chlamydiota Garrity & Holt 2021(L,G)[12.26] bzw. corrig. Garrity & Holt 2021(N) [ „Chlamydiota“ Whitman et al. 2018(L), „Chlamydaeota“ Oren et al. 2015(L,N), „Chlamydiae“ Garrity & Holt 2001(L,N) (s. l.)]
- Phylum Kiritimatiellota Spring et al. 2021(L) bzw. corrig. Spring et al. 2021(N) [„Kiritimatiellaeota“ Spring et al. 2016(L,N)] (früher Verrucomicrobia subdivision 5(N); Kiritimatiellia etc.)
– in der GTDB zu Verrucomicrobiota(G)
- Phylum Lentisphaerota Cho et al. 2021(L) bzw. corrig. Cho et al. 2021(N) [„Lentisphaerota“ Whitman et al. 2018(L), „Lentisphaeraeota“ Oren et al. 2015(L,N), „Lentisphaerae“ Cho et al. 2004(L,N) (s. l.)]
– in der GTDB zu Verrucomicrobiota(G)
- Phylum „Candidatus Omnitrophota“ corrig. Rinke et al. 2013(L,G)[12.27] bzw. Williams et al. 2021(N) [„Ca. Omnitrophica“ Rinke et al. 2013(L,N), „Ca. Omnitrophicaeota“(N)]
– in der LPSN Bakterien incertae sedis(L)
- Phylum Planctomycetota Garrity & Holt 2021(L,G)[12.28] bzw. corrig. Garrity & Holt 2021(N) [„Planctomycetota“ Whitman et al. 2018(L,N), „Planctomycetaeota“ Oren et al. 2015(L,N), „Planctomycetes“ Garrity & Holt 2001(L,N) bzw. Garrity & Holt 2001 emend. Ward 2011(N) (s. l.), „Planctobacteria“ (Cavalier-Smith 1987) Cavalier-Smith 2020(L) bzw. 2002(N) (s. l.)]
- Phylum Verrucomicrobiota Hedlund 2021(L,G)[12.29] [„Verrucomicrobiota“ Whitman et al. 2018(L), „Verrucomicrobaeota“ Oren et al. 2015(L), „Verrucomicrobia“ Hedlund 2010(L) (s. l.)]
- L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ)[1]
- N – Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI)[5]
- G – Genome Taxonomy Database (GTDB)[12]
Das Phylum
- Thermodesulfobiota Frolov et al. 2023
gehört nach der maßgeblichen LPSN als Synonym von Bacillota zum Reich Bacillati[14] (wird aber in der NCBI-Taxonomie hier zu zu Pseudomonadati(N) klassifiziert).[5]
Als Bakteriengruppen incertae sedis wird heute (18. Januar 2026) in der LPSN und NCBI-Taxonomie angesehen:
Phylogenie und Taxonomie
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Es wird heute (Stand 2009) angenommen, dass sich Pseudomonadati und Bacillati vor etwa 3 Milliarden Jahren auseinanderentwickelt haben, was darauf hindeutet, dass das Land (die Urkontinente, d. h. Kratone) zu dieser Zeit von Prokaryoten besiedelt war.[2]
Einige ältere nicht „unrooted“ molekulare phylogenetische Analysen haben die Dichotomie von Bacillati und Pseudomonadati nicht bestätigt,[16][17] aber die neuere genomischen Analysen,[11] einschließlich solcher, die sich auf die Verwurzelung des Stammbaums konzentriert haben,[10] haben ergeben, dass diese beiden Gruppen monophyletisch sind.
Zusammen bilden Pseudomonadati und Bacillati eine große Klade, die 99 % aller bis 2009 bekannten Bakterienarten, und 97 % der Prokaryoten (Bakterien und Archaeen) umfasst.[A. 1] und von Battistuzzi und Hedges in Anspielung auf die phototrophen Fähigkeiten vieler Mitglieder per Vorschlag als „Selabacteria“ bezeichnet wurde (von altgriechisch σέλας selas, deutsch ‚Licht‘).[18] Mit Stand 2022 wurde noch diskutiert, welche bakteriellen Phyla außerhalb der Reiche Pseudomonadati und Bacillati liegen und somit das Taxon Selabacteria rechtfertigen.[10][11] Inzwischen gelten die Fusobacteriati und Thermotogati als anerkannte weitere Bakterienreiche.[1][5] Die Definition der beiden Reiche Pseudomonadati und Bacillati als Hauptkladen innerhalb der Domäne Bacteria basiert größtenteils auf verwurzelten phylogenetischen Analysen von Genomen.[3][2][10][11] Nicht verwurzelte Analysen haben diese Einteilung nicht vollständig bestätigt,[17][16] was die Bedeutung verwurzelter Stammbäume des Lebens unterstreicht.
Phylogenie 2009
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Phylogenie 2022
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Zwei jüngere Analysen der bakteriellen Phylogenie (2021 und 2022) stützten beide die Unterteilung in Pseudomonadati und Bacillati.[10][11] Allerdings interpretierten sie die Evolution der Zellwand unterschiedlich: Die eine Studie kam zu dem Schluss, dass der letzte gemeinsame Vorfahr der Bakterien (last bacterial common ancestor, LBCA) ein Monoderm (grampositives Bakterium) war,[10] die andere, dass es sich um einen Diderm (gramnegatives Bakterium) handelte.[11] Der folgende Stammbaum wurde aus einer der beiden Studien neu gezeichnet und zeigt die Phylogenie der bakteriellen Phyla und Superphyla, wobei die Position der Fusobacteriota dort noch unklar ist und die DST-Gruppe (siehe Thermotogati) der nächste Verwandte der Bacillati ist:[A. 14][10]
-
Eine Phylogenie der bakteriellen Phyla und Superphyla nach Coleman et al. (2021).[10] Pseudomonadati wird in dieser Studie als „Gracilicutes“ (bzw. „Hydrobacteria“) bezeichnet, Bacillati als „Terrabacteria“, Fusobacteriati ist durch „Fusobacteria“ repräsentiert und Thermotogati durch die DST-Gruppe.
Anmerkungen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ a b ohne die sog. mikrobielle dunkle Materie: DNA-Sequenzen aus der Metagenomik etc.
- ↑ Im Gegensatz dazu besitzen Arten der Bacillati („Terrabacterida“,[6] Terrabakterien) Anpassungen für das Leben an Land
- ↑ mit Klasse Oligoflexia; eigenes Phylum in der NCBI-Taxonomie, Synonym in der LPSN
- ↑ mit Klasse Epsilonproteobacteria [„Campylobacteria“, „Nautiliia“]; eigenes Phylum in der NCBI-Taxonomie, Synonym in der LPSN
- ↑ in der GTDB zu Chrysiogenota
- ↑ Desulfobacteria, Desulfuromonadia, Dissulfuribacteria, …
- ↑ mit Klasse Myxococcia, …; eigenes Phylum in der NCBI-Taxonomie, Synonym in der LPSN
- ↑ Proteobacteria s. l., d. h. als Phylum, nicht Klasse: Purpurbakterien und Verwandte
- ↑ Laut GTDB gehört der Stamm Candidate division LCP-89 bacterium B3_LCP zum Phylum Electryoneota, d. h. dieses Kandidaten-Phylum und Candidate dvision LCP-89 sind synonym
- ↑ a b in der LPSN Bakterien incertae sedis(L)
- ↑ in der LPSN verwaist, in der NCBI-Taxonomie synonym zu Fidelibacterota[13]
- ↑ mit Fidelibacterota bacterium UBA1134(N) [Ca. Marinimicrobia bacterium UBA1134(G)] Stamm (MAG) UBA1134, Zugriffsnummer DCAL01000000.[12.19][5.1]
- ↑ Zu unterscheiden von Burkholderia sp. TM6 und Pseudomonas sp. TM6 (zu Beta- bzw. Gammaproteobacteria und damit im Phylum Pseudomonadota [Proteobacteriota]).
- ↑ Coleman et al. (2021) benannten die aus Thermotogota, Deinococcota, Synergistota und verwandten Arten bestehende Klade als DST; siehe Reich Thermotogati.[10]
Einzelnachweise
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ a b c d e f g h i j LPSN: Kingdom Pseudomonadati (Gibbons and Murray 1978) Oren and Göker 2024.
- ↑ a b c d e f g Fabia U. Battistuzzi, S. Blair Hedges: A major clade of prokaryotes with ancient adaptations to life on land. In: Molecular Biology and Evolution. 26. Jahrgang, Nr. 2, Februar 2009, S. 335–343, doi:10.1093/molbev/msn247, PMID 18988685 (englisch).
- ↑ a b c d Fabia U. Battistuzzi, Andreia Feijao, S. Blair Hedges: A genomic timescale of prokaryote evolution: insights into the origin of methanogenesis, phototrophy, and the colonization of land. In: BMC Evolutionary Biology. 4. Jahrgang, November 2004, S. 44, doi:10.1186/1471-2148-4-44, PMID 15535883, PMC 533871 (freier Volltext) – (englisch).
- ↑ Norberto J. Palleroni: The Pseudomonas Story. In: Environmental Microbiology. Band 12, Nr. 6, 7. Juni 2010, S. 1377–1383; doi:10.1111/j.1462-2920.2009.02041.x, PMID 20553550, bibcode:2010EnvMi..12.1377P (englisch).
- ↑ a b c d e f g
NCBI Taxonomy Browser: Pseudomonadati, Details: Pseudomonadati (Gibbons and Murray 1978) Oren and Göker 2024. Graphisch: Pseudomonadati, auf: Lifemap.
- ↑ Nucleotide: Fidelibacterota bacterium UBA1134, ….
- ↑ a b c Stefan Luketa: New views on the megaclassification of life. In: Protistology, Band 7, Nr. 4, Januar 2012, S. 218–237; ResearchGate:250308890 (englisch).
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![Eine Phylogenie der bakteriellen Phyla und Superphyla nach Coleman et al. (2021).[10] Pseudomonadati wird in dieser Studie als „Gracilicutes“ (bzw. „Hydrobacteria“) bezeichnet, Bacillati als „Terrabacteria“, Fusobacteriati ist durch „Fusobacteria“ repräsentiert und Thermotogati durch die DST-Gruppe.](/media/wikipedia/commons/c/ce/Bacterial_phyla_and_superphyla.png)