Der Limestone River bildet den Abfluss des Limestone Lake. Er verlässt diesen an dessen Nordufer und fließt in überwiegend östlicher Richtung. Er bildet dabei zahlreiche Flussschlingen und Altarme aus. Der Limestone River fließt südlich am Little Limestone Lake vorbei. Der Bahnhaltepunkt Bird der Hudson Bay Railway von The Pas nach Churchill liegt am Unterlauf des Flusses. Kurz darauf, 3,6km oberhalb der Mündung, überquert die Bahnstrecke den Limestone River. Die Mündung des Limestone River befindet sich direkt unterhalb des am Nelson River gelegenen Wasserkraftwerks Limestone. 900m oberhalb der Mündung kreuzt die Manitoba Provincial Road 290 den Fluss.
Der Limestone River entwässert ein Areal von ungefähr 3330km². Der mittlere Abfluss am Pegel 7km oberhalb der Mündung beträgt 21,3m³/s. Im Mai treten mit 63,9m³/s im Mittel die höchsten monatlichen Abflüsse auf.[1]
