Der Lake Nisson befindet sich, umgeben von einem Feuchtgebiet, zwischen dem WaiatotoRiver, 1,25km ostnordöstlich und dem ArawhataRiver, rund 5,5km westsüdwestlich. Haast als nächstgrößerem Ort ist rund 25km in nordöstlicher Richtung zu finden. Der See liegt in einer bis zu 3km breiten Ebene zwischen dem 671m hohen Mount McLean im Nordwesten und dem 1503m hohen Mount Watney im Südosten. Das Gewässer umfasst eine Fläche von 54,7Hektar und besitzt einen Umfang von rund 3,05km. Mit einer Südwest-Nordost-Ausrichtung erstreckt sich der See über eine Länge von rund 960m und misst dabei an seiner breitesten Stelle rund 820m in Nordwest-Südost-Richtung.[1][2]
Zulauf bekommt der Lake Nisson hauptsächlich vom Hindley Creek, vom Sounter Stream und von einem nicht näher bezeichneten Bach. Der Nisson Creek hingegen entwässert den See und mündet rund 2,2Flusskilometer weiter in den WaiatotoRiver.[1][2]
