Der Lake Ellery befindet sich zwischen dem ArawhataRiver im OstwestOsten und dem Jackson River im Süden, rund 4,5km südlich der Jackson Bay/Okahu und der Tasmansee. Der See, der sich auf einer Höhe von 12m zwischen den Bergen der bis zu 793m hohen Burmeister Tops ist Osten und den bis zu 890m hohen Stafford Range im Westen befindet, besitzt eine Flächenausdehnung von rund 3,87km². Mit einer Länge von rund 4,6km erstreckt sich der See in einer Nordwest-Südost-Richtung und misst an seiner breitesten Stelle rund 1,1km in Südwest-Nordost-Richtung.[1][2]
Gespeist wird der Lake Ellery von den verschiedenen Streams und Creeks, der umliegenden Bergen. Entwässert wird der See an seinem südöstlichen Ende über einen kleinen bis zu 1,5km langen Stream, der ostnordöstlich in den Jackson River mündet.[1][2]