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List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature

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(Weitergeleitet von LPSN)

Die List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) ist eine Online-Datenbank, in der Informationen zur Benennung und Taxonomie von Prokaryoten gemäß den Taxonomieanforderungen und -bestimmungen des Internationalen Codes für die Nomenklatur von Prokaryoten (“International Code of Nomenclature of Prokaryotes”, ICNP, früher auch als “International Code of Nomenclature of Bacteria” oder „Bakteriologischer Code“) geführt werden.[1] Der Name der Datenbank bedeutet in etwa „Liste der prokaryotischen Namen mit ihrem Stand in der Nomenklatur.“

Die Datenbank wurde von 1997 bis Juni 2013 von Jean P. Euzéby[2][3] und ab Juli 2013 von Aidan C. Parte[4] kuratiert. Die Prokaryotentaxonomie (die Taxonomie von Archaeen und Bakterien) wird u. a. durch die Zeitschrift International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB/IJSEM) aktualisiert.[1]

Die Datenbank wurde 2019 von der Deutschen Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ) erworben und im Februar 2020 neu gestartet, wobei ein neues technisches System für die Datenbank verwendet wurde. Zuvor hatte die DSMZ seit 1993 eine der LPSN ähnliche Datenbank mit dem Namen “Prokaryotic Nomenclature Up-to-date” (PNU, „Prokaryotische Nomenklatur auf dem aktuellen Stand“) betrieben. Somit wurde entschieden, die beiden Datenbanken zu einem neuen Webangebot zusammenzuführen und dabei das Akronym LPSN weiterzuführen, wegen dessen Bekanntheit in der wissenschaftlichen Gemeinschaft.[5]

Kriterium für Aufnahme eines Taxonnamens in die LPSN-Datenbank sind eine wissenschaftliche Veröffentlichung, d. h. eine "effektive Publikation" nach den Regeln des ICNP. Die LPSN führt aber auch nach dem ICNP nicht valide publizierte Taxonnamen (in Anführungszeichen), unter anderen Namen von Candidatus-Taxa.[6] Zu den Informationen, die in der Datenbank für ein bestimmtes Taxon, z. B. eine Art, abrufbar sind, gehört unter anderem die Etymologie des wissenschaftlichen Namens, ob er nach den Regeln des ICNP und taxonomischer Meinung von LPSN der korrekte Name ist oder ob es sich um ein Synonym handelt. Die Verlinkung zu den Artikeln der Erstbeschreibung oder erweiterten Beschreibung des Taxons erfolgt wenn möglich per Digital Object Identifier (DOI).[5] Seit 2026 enthält LPSN die List of Recommended Names for bacteria with medical importance sowie Hinweise zur Aussprache der Taxonnamen.[1][7]

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Einzelnachweise

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  1. 1 2 3 Heike M Freese, Jan P Meier-Kolthoff, Joaquim Sardà Carbasse, Ayorinde O Afolayan, Markus Göker: TYGS and LPSN in 2025: a Global Core Biodata Resource for genome-based classification and nomenclature of prokaryotes within DSMZ Digital Diversity. In: Nucleic Acids Research. Band 54, D1, 6. Januar 2026, ISSN 0305-1048, S. D884–D891, doi:10.1093/nar/gkaf1110, PMID 41160892, PMC 12807606 (freier Volltext) – (oup.com [abgerufen am 16. Oktober 2026]).
  2. ↑ J. P. Euzéby: List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a Folder Available on the Internet. In: International Journal of Systematic Bacteriology. Band 47, Nr. 2, April 1997, S. 590–592, ISSN 0020-7713. doi:10.1099/00207713-47-2-590.
  3. ↑ Lawrence P. Wackett: Microbial strain collections and information. In: Microbial Biotechnology. 7, 2014, S. 371, doi:10.1111/1751-7915.12135.
  4. ↑ Aidan C. Parte: LPSN—list of prokaryotic names with standing in nomenclature. In: Nucleic Acids Research. 42, 2013, S. D613, doi:10.1093/nar/gkt1111.
  5. 1 2 Aidan C. Parte, Joaquim Sardà Carbasse, Jan P. Meier-Kolthoff, Lorenz C. Reimer, Markus Göker: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 70, Nr. 11, 1. November 2020, S. 5607–5612, doi:10.1099/ijsem.0.004332 (dsmz.de [abgerufen am 30. März 2024]).
  6. ↑ Jan P Meier-Kolthoff, Joaquim Sardà Carbasse, Rosa L Peinado-Olarte, Markus Göker: TYGS and LPSN: a database tandem for fast and reliable genome-based classification and nomenclature of prokaryotes. In: Nucleic Acids Research. Band 50, D1, 7. Januar 2022, ISSN 0305-1048, S. D801–D807, doi:10.1093/nar/gkab902, PMID 34634793, PMC 8728197 (freier Volltext) – (oup.com [abgerufen am 16. Oktober 2026]).
  7. ↑ Markus Göker, Henrik Christensen, Volker Fingerle, Marko Kostovski, Gabriele Margos, Edward R. B. Moore, Aharon Oren, Sheila Patrick, Udo Reischl, José A. Vázquez-Boland: List of Recommended Names for bacteria of medical importance: report of the Ad Hoc Committee on Mitigating Changes in Prokaryotic Nomenclature. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 75, Nr. 10, 23. Oktober 2025, ISSN 1466-5026, doi:10.1099/ijsem.0.006943, PMID 41129200, PMC 12548757 (freier Volltext) – (microbiologyresearch.org [abgerufen am 16. Oktober 2026]).
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