Links die flache Erhebung hinter dem Ort Holzhausen ist der Junkernkopf, rechts im Bild ist das Osterbachtal, darüber rechts der Osterberg und dahinter der Gahrenberg als höchster Gipfel zu sehen.
Der größtenteils bewaldete Junkernkopf liegt im Südwesten des Reinhardswaldes rund 3,7km östlich von Mariendorf (nördlicher Stadtteil von Immenhausen), etwa 2,5km östlich von dessen Wohngebiet Ahlberg (am Ahlberg) und zirka 4km (je Luftlinie) nördlich von Holzhausen (östlicher Stadtteil von Immenhausen). Seine Gipfelregion befindet sich auf der von Holzhausen durch den Reinhardswald nach Veckerhagen führenden Landesstraße3232, von der ein paar Kilometer nördlich des Junkernkopfs eine Straße abzweigt, auf der man zur Sababurg und nach Gottsbüren gelangen kann. Etwa 200m südwestlich der Gipfelregion steht das NaturdenkmalGerichtseiche[2].
Der Junkernkopf ist etwa 453m hoch. Auf der über seine Gipfelregion verlaufenden L3232 ist topographischen Karten die Höhe 452,9m[2] zu entnehmen, was jedoch nicht unbedingt für die höchste Bergstelle steht. Rund 550m westlich davon liegt im Rahmen eines Forstweges ein Vermessungspunkt (⊙51.4541944444449.5346388888889) auf 451,5m[4].
Der Junkernkopf liegt auf der Diemel-Fulda-Wasserscheide, die ein Teil der Diemel-Eder/Fulda/Weser-Wasserscheide ist: Während Hemelbach und Nasse Ahle nach Nordosten in die Weser, Mühlbach und Osterbach nach Süden und Osten in die Fulda und dann in die Weser fließt, verläuft die Lempe, die ungefähr 2,7km nordnordwestlich der Osterbachquelle jenseits des Bergs entspringt, zumeist nordwestwärts in die Esse, die über die Diemel nach Norden der Weser zustrebt. Südsüdwestlich entspringt zudem die Holzkape, die in Richtung Westen fließt und unweit davon auch in die Esse mündet.
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