COPS6

COPS6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4D10, 4D18, 4QFT, 4R14, 4WSN
Ідентифікатори
Символи	COPS6, CSN6, MOV34-34KD, COP9 signalosome subunit 6
Зовнішні ІД	OMIM: 614729 MGI: 1349439 HomoloGene: 4977 GeneCards: COPS6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • COP9 signalosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • transcription-coupled nucleotide-excision repair • GO:0022415 viral process • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • protein deneddylation • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10980	26893
Ensembl	ENSG00000168090	ENSMUSG00000019494
UniProt	Q7L5N1	O88545
RefSeq (мРНК)	NM_006833	NM_012002
RefSeq (білок)	NP_006824	NP_036132
Локус (UCSC)	Хр. 7: 100.09 – 100.09 Mb	Хр. 5: 138.16 – 138.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COPS6 (англ. COP9 signalosome subunit 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 327 амінокислот, а молекулярна маса — 36 163.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAAAAAAA		TNGTGGSSGM		EVDAAVVPSV		MACGVTGSVS		VALHPLVILN
ISDHWIRMRS		QEGRPVQVIG		ALIGKQEGRN		IEVMNSFELL		SHTVEEKIII
DKEYYYTKEE		QFKQVFKELE		FLGWYTTGGP		PDPSDIHVHK		QVCEIIESPL
FLKLNPMTKH		TDLPVSVFES		VIDIINGEAT		MLFAELTYTL		ATEEAERIGV
DHVARMTATG		SGENSTVAEH		LIAQHSAIKM		LHSRVKLILE		YVKASEAGEV
PFNHEILREA		YALCHCLPVL		STDKFKTDFY		DQCNDVGLMA		YLGTITKTCN
TMNQFVNKFN		VLYDRQGIGR		RMRGLFF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Hoareau Alves K., Bochard V., Rety S., Jalinot P. (2002). Association of the mammalian proto-oncoprotein Int-6 with the three protein complexes eIF3, COP9 signalosome and 26S proteasome. FEBS Lett. 527: 15—21. PMID 12220626 doi:10.1016/S0014-5793(02)03147-2
• Ramanathan M.P., Curley E. III, Su M., Chambers J.A., Weiner D.B. (2002). Carboxyl terminus of hVIP/mov34 is critical for HIV-1-Vpr interaction and glucocorticoid-mediated signaling. J. Biol. Chem. 277: 47854—47860. PMID 12237292 doi:10.1074/jbc.M203905200
• Zhao L.-J., Mukherjee S., Narayan O. (1994). Biochemical mechanism of HIV-I Vpr function. Specific interaction with a cellular protein. J. Biol. Chem. 269: 15577—15582. PMID 8195203

Див. також

• Хромосома 7