CHRNA7

CHRNA7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5AFK, 5AFJ, 5AFL, 2MAW, 5AFN, 5AFM, 5AFH
Ідентифікатори
Символи	CHRNA7, CHRNA7-2, NACHRA7, cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 118511 MGI: 99779 HomoloGene: 593 GeneCards: CHRNA7
Реагує на сполуку
encenicline, PNU-120596, mecamylamine, AZD0328, encenicline
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • acetylcholine binding • acetylcholine-gated cation-selective channel activity • amyloid-beta binding • acetylcholine receptor activity • ion channel activity • chloride channel regulator activity • extracellular ligand-gated ion channel activity • toxic substance binding • ligand-gated ion channel activity • transmembrane signaling receptor activity • calcium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • acetylcholine-gated channel complex • postsynaptic membrane • мембрана • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • integral component of plasma membrane • neuron projection • plasma membrane raft • postsynapse Біологічний процес • response to hypoxia • когнітивність • cellular calcium ion homeostasis • ion transport • positive regulation of angiogenesis • ion transmembrane transport • positive regulation of cell population proliferation • GO:0015915 транспорт • calcium ion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • synaptic transmission, cholinergic • пам'ять • negative regulation of tumor necrosis factor production • response to nicotine • regulation of postsynaptic membrane potential • excitatory postsynaptic potential • positive regulation of protein phosphorylation • chemical synaptic transmission • learning or memory • короткочасна пам'ять • regulation of membrane potential • synapse organization • nervous system process • sensory processing • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • calcium ion transmembrane transport • acetylcholine receptor signaling pathway • dendritic spine organization • modulation of excitatory postsynaptic potential • dendrite arborization • positive regulation of long-term synaptic potentiation • regulation of neuron death • positive regulation of amyloid-beta formation • negative regulation of amyloid-beta formation • regulation of amyloid precursor protein catabolic process • response to amyloid-beta • response to acetylcholine • regulation of amyloid fibril formation • positive regulation of CoA-transferase activity • positive regulation of excitatory postsynaptic potential Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1139	11441
Ensembl	ENSG00000274542 ENSG00000175344 ENSG00000282088	ENSMUSG00000030525
UniProt	P36544	P49582
RefSeq (мРНК)	NM_000746 NM_001190455	NM_007390
RefSeq (білок)	NP_000737 NP_001177384	NP_031416
Локус (UCSC)	Хр. 15: 31.92 – 32.17 Mb	Хр. 7: 62.75 – 62.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHRNA7 (англ. CHRNA7 (exons 5-10) and FAM7A (exons A-E) fusion) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 56 449.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRCSPGGVWL		ALAASLLHVS		LQGEFQRKLY		KELVKNYNPL		ERPVANDSQP
LTVYFSLSLL		QIMDVDEKNQ		VLTTNIWLQM		SWTDHYLQWN		VSEYPGVKTV
RFPDGQIWKP		DILLYNSADE		RFDATFHTNV		LVNSSGHCQY		LPPGIFKSSC
YIDVRWFPFD		VQHCKLKFGS		WSYGGWSLDL		QMQEADISGY		IPNGEWDLVG
IPGKRSERFY		ECCKEPYPDV		TFTVTMRRRT		LYYGLNLLIP		CVLISALALL
VFLLPADSGE		KISLGITVLL		SLTVFMLLVA		EIMPATSDSV		PLIAQYFAST
MIIVGLSVVV		TVIVLQYHHH		DPDGGKMPKW		TRVILLNWCA		WFLRMKRPGE
DKVRPACQHK		QRRCSLASVE		MSAVAPPPAS		NGNLLYIGFR		GLDGVHCVPT
PDSGVVCGRM		ACSPTHDEHL		LHGGQPPEGD		PDLAKILEEV		RYIANRFRCQ
DESEAVCSEW		KFAACVVDRL		CLMAFSVFTI		ICTIGILMSA		PNFVEAVSKD
FA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Groot Kormelink P.J., Luyten W.H.M.L. (1997). Cloning and sequence of full-length cDNAs encoding the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) subunits beta3 and beta4 and expression of seven nAChR subunits in the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y and/or IMR-32. FEBS Lett. 400: 309—314. PMID 9009220 doi:10.1016/S0014-5793(96)01383-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Riley B., Williamson M., Collier D., Wilkie H., Makoff A. (2002). A 3-Mb map of a large segmental duplication overlapping the alpha7-nicotinic acetylcholine receptor gene (CHRNA7) at human 15q13-q14. Genomics. 79: 197—209. PMID 11829490 doi:10.1006/geno.2002.6694
• Peng X., Katz M., Gerzanich V., Anand R., Lindstrom J. (1994). Human alpha 7 acetylcholine receptor: cloning of the alpha 7 subunit from the SH-SY5Y cell line and determination of pharmacological properties of native receptors and functional alpha 7 homomers expressed in Xenopus oocytes. Mol. Pharmacol. 45: 546—554. PMID 8145738

Див. також

• Хромосома 15