ATG4D

ATG4D
Ідентифікатори
Символи	ATG4D, APG4-D, APG4D, AUTL4, autophagy related 4D cysteine peptidase, HsAPG4D
Зовнішні ІД	OMIM: 611340 MGI: 2444308 HomoloGene: 13156 GeneCards: ATG4D
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія Біологічний процес • автофагія • protein transport • autophagy of nucleus • C-terminal protein lipidation • protein delipidation • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • протеоліз • protein targeting to membrane • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84971	235040
Ensembl	ENSG00000130734	ENSMUSG00000002820
UniProt	Q86TL0	Q8BGV9
RefSeq (мРНК)	NM_001281504 NM_032885	NM_153583
RefSeq (білок)	NP_001268433 NP_116274	NP_705811
Локус (UCSC)	Хр. 19: 10.54 – 10.55 Mb	Хр. 9: 21.18 – 21.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATG4D (англ. Autophagy related 4D cysteine peptidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 474 амінокислот, а молекулярна маса — 52 922.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSVSPAAAQ		YRSSSPEDAR		RRPEARRPRG		PRGPDPNGLG		PSGASGPALG
SPGAGPSEPD		EVDKFKAKFL		TAWNNVKYGW		VVKSRTSFSK		ISSIHLCGRR
YRFEGEGDIQ		RFQRDFVSRL		WLTYRRDFPP		LPGGCLTSDC		GWGCMLRSGQ
MMLAQGLLLH		FLPRDWTWAE		GMGLGPPELS		GSASPSRYHG		PARWMPPRWA
QGAPELEQER		RHRQIVSWFA		DHPRAPFGLH		RLVELGQSSG		KKAGDWYGPS
LVAHILRKAV		ESCSDVTRLV		VYVSQDCTVY		KADVARLVAR		PDPTAEWKSV
VILVPVRLGG		ETLNPVYVPC		VKELLRCELC		LGIMGGKPRH		SLYFIGYQDD
FLLYLDPHYC		QPTVDVSQAD		FPLESFHCTS		PRKMAFAKMD		PSCTVGFYAG
DRKEFETLCS		ELTRVLSSSS		ATERYPMFTL		AEGHAQDHSL		DDLCSQLAQP
TLRLPRTGRL		LRAKRPSSED		FVFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Betin V.M., Lane J.D. (2009). Caspase cleavage of Atg4D stimulates GABARAP-L1 processing and triggers mitochondrial targeting and apoptosis. J. Cell Sci. 122: 2554—2566. PMID 19549685 doi:10.1242/jcs.046250
• Betin V.M., MacVicar T.D., Parsons S.F., Anstee D.J., Lane J.D. (2012). A cryptic mitochondrial targeting motif in Atg4D links caspase cleavage with mitochondrial import and oxidative stress. Autophagy. 8: 664—676. PMID 22441018 doi:10.4161/auto.19227

Див. також

• Хромосома 19