ALKBH4

(пол.)

ALKBH4
Ідентифікатори
Символи	ALKBH4, ABH4, alkB homolog 4, lysine demethylase
Зовнішні ІД	OMIM: 613302 MGI: 1919291 HomoloGene: 9747 GeneCards: ALKBH4
Онтологія гена Молекулярна функція • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • oxidoreductase activity • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • demethylase activity • dioxygenase activity • зв’язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • midbody • contractile ring • клітинне ядро Біологічний процес • actomyosin structure organization • protein demethylation • Деметилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cleavage furrow ingression • transcription, DNA-templated • oxidative demethylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54784	72041
Ensembl	ENSG00000160993	ENSMUSG00000039754
UniProt	Q9NXW9	Q9D8F1
RefSeq (мРНК)	NM_017621	NM_028070 NM_001347492 NM_001359414 NM_001359415 NM_001359416 NM_001359417
RefSeq (білок)	NP_060091	NP_001334421 NP_082346 NP_001346343 NP_001346344 NP_001346345 NP_001346346
Локус (UCSC)	Хр. 7: 102.46 – 102.46 Mb	Хр. 5: 136.17 – 136.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ALKBH4 (англ. AlkB homolog 4, lysine demethylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 302 амінокислот, а молекулярна маса — 33 838.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAAAETPE		VLRECGCKGI		RTCLICERQR		GSDPPWELPP		AKTYRFIYCS
DTGWAVGTEE		SDFEGWAFPF		PGVMLIEDFV		TREEEAELVR		LMDRDPWKLS
QSGRRKQDYG		PKVNFRKQKL		KTEGFCGLPS		FSREVVRRMG		LYPGLEGFRP
VEQCNLDYCP		ERGSAIDPHL		DDAWLWGERL		VSLNLLSPTV		LSMCREAPGS
LLLCSAPSAA		PEALVDSVIA		PSRSVLCQEV		EVAIPLPARS		LLVLTGAARH
QWKHAIHRRH		IEARRVCVTF		RELSAEFGPG		GRQQELGQEL		LRIALSFQGR
PV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном заліза. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Bjornstad L.G., Zoppellaro G., Tomter A.B., Falnes P.O., Andersson K.K. (2011). Spectroscopic and magnetic studies of wild-type and mutant forms of the Fe(II)-and 2-oxoglutarate-dependent decarboxylase ALKBH4. Biochem. J. 434: 391—398. PMID 21166655 doi:10.1042/BJ20101667

Див. також

• Хромосома 7