ADAMTS9

ADAMTS9
Ідентифікатори
Символи	ADAMTS9, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9
Зовнішні ІД	OMIM: 605421 MGI: 1916320 HomoloGene: 18821 GeneCards: ADAMTS9
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • metalloendopeptidase activity • endopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв’язування з іоном металу Клітинна компонента • extracellular region • cell surface • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • ендоплазматичний ретикулум • внутрішньоклітинна мембранна органела • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • multicellular organism development • protein transport • regulation of developmental pigmentation • vesicle-mediated transport • positive regulation of melanocyte differentiation • протеоліз • glycoprotein catabolic process • heart valve morphogenesis • ventricular cardiac muscle tissue development • negative regulation of endothelial cell migration • extracellular matrix organization • aorta morphogenesis • endothelial cell-matrix adhesion • negative regulation of sprouting angiogenesis • response to bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56999	101401
Ensembl	ENSG00000163638	ENSMUSG00000030022
UniProt	Q9P2N4	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_182920 NM_001318781 NM_020249 NM_182921	NM_175314
RefSeq (білок)	NP_001305710 NP_891550	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 3: 64.52 – 64.69 Mb	Хр. 6: 92.75 – 92.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ADAMTS9 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 935 амінокислот, а молекулярна маса — 216 491.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQFVSWATLL		TLLVRDLAEM		GSPDAAAAVR		KDRLHPRQVK		LLETLSEYEI
VSPIRVNALG		EPFPTNVHFK		RTRRSINSAT		DPWPAFASSS		SSSTSSQAHY
RLSAFGQQFL		FNLTANAGFI		APLFTVTLLG		TPGVNQTKFY		SEEEAELKHC
FYKGYVNTNS		EHTAVISLCS		GMLGTFRSHD		GDYFIEPLQS		MDEQEDEEEQ
NKPHIIYRRS		APQREPSTGR		HACDTSEHKN		RHSKDKKKTR		ARKWGERINL
AGDVAALNSG		LATEAFSAYG		NKTDNTREKR		THRRTKRFLS		YPRFVEVLVV
ADNRMVSYHG		ENLQHYILTL		MSIVASIYKD		PSIGNLINIV		IVNLIVIHNE
QDGPSISFNA		QTTLKNFCQW		QHSKNSPGGI		HHDTAVLLTR		QDICRAHDKC
DTLGLAELGT		ICDPYRSCSI		SEDSGLSTAF		TIAHELGHVF		NMPHDDNNKC
KEEGVKSPQH		VMAPTLNFYT		NPWMWSKCSR		KYITEFLDTG		YGECLLNEPE
SRPYPLPVQL		PGILYNVNKQ		CELIFGPGSQ		VCPYMMQCRR		LWCNNVNGVH
KGCRTQHTPW		ADGTECEPGK		HCKYGFCVPK		EMDVPVTDGS		WGSWSPFGTC
SRTCGGGIKT		AIRECNRPEP		KNGGKYCVGR		RMKFKSCNTE		PCLKQKRDFR
DEQCAHFDGK		HFNINGLLPN		VRWVPKYSGI		LMKDRCKLFC		RVAGNTAYYQ
LRDRVIDGTP		CGQDTNDICV		QGLCRQAGCD		HVLNSKARRD		KCGVCGGDNS
SCKTVAGTFN		TVHYGYNTVV		RIPAGATNID		VRQHSFSGET		DDDNYLALSS
SKGEFLLNGN		FVVTMAKREI		RIGNAVVEYS		GSETAVERIN		STDRIEQELL
LQVLSVGKLY		NPDVRYSFNI		PIEDKPQQFY		WNSHGPWQAC		SKPCQGERKR
KLVCTRESDQ		LTVSDQRCDR		LPQPGHITEP		CGTDCDLRWH		VASRSECSAQ
CGLGYRTLDI		YCAKYSRLDG		KTEKVDDGFC		SSHPKPSNRE		KCSGECNTGG
WRYSAWTECS		KSCDGGTQRR		RAICVNTRND		VLDDSKCTHQ		EKVTIQRCSE
FPCPQWKSGD		WSECLVTCGK		GHKHRQVWCQ		FGEDRLNDRM		CDPETKPTSM
QTCQQPECAS		WQAGPWGQCS		VTCGQGYQLR		AVKCIIGTYM		SVVDDNDCNA
ATRPTDTQDC		ELPSCHPPPA		APETRRSTYS		APRTQWRFGS		WTPCSATCGK
GTRMRYVSCR		DENGSVADES		ACATLPRPVA		KEECSVTPCG		QWKALDWSSC
SVTCGQGRAT		RQVMCVNYSD		HVIDRSECDQ		DYIPETDQDC		SMSPCPQRTP
DSGLAQHPFQ		NEDYRPRSAS		PSRTHVLGGN		QWRTGPWGAC		SSTCAGGSQR
RVVVCQDENG		YTANDCVERI		KPDEQRACES		GPCPQWAYGN		WGECTKLCGG
GIRTRLVVCQ		RSNGERFPDL		SCEILDKPPD		REQCNTHACP		HDAAWSTGPW
SSCSVSCGRG		HKQRNVYCMA		KDGSHLESDY		CKHLAKPHGH		RKCRGGRCPK
WKAGAWSQCS		VSCGRGVQQR		HVGCQIGTHK		IARETECNPY		TRPESERDCQ
GPRCPLYTWR		AEEWQECTKT		CGEGSRYRKV		VCVDDNKNEV		HGARCDVSKR
PVDRESCSLQ		PCEYVWITGE		WSECSVTCGK		GYKQRLVSCS		EIYTGKENYE
YSYQTTINCP		GTQPPSVHPC		YLRDCPVSAT		WRVGNWGSCS		VSCGVGVMQR
SVQCLTNEDQ		PSHLCHTDLK		PEERKTCRNV		YNCELPQNCK		EVKRLKGASE
DGEYFLMIRG		KLLKIFCAGM		HSDHPKEYVT		LVHGDSENFS		EVYGHRLHNP
TECPYNGSRR		DDCQCRKDYT		AAGFSSFQKI		RIDLTSMQII		TTDLQFARTS
EGHPVPFATA		GDCYSAAKCP		QGRFSINLYG		TGLSLTESAR		WISQGNYAVS
DIKKSPDGTR		VVGKCGGYCG		KCTPSSGTGL		EVRVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 doi:10.1093/dnares/7.1.65

Див. також

• Хромосома 3