DFB-Pokalsieger 1965 wurde Borussia Dortmund. Das Finale fand am 22. Mai 1965 in Hannover statt. Durch diesen Titel qualifizierte sich Borussia Dortmund für den Europapokal der Pokalsieger 1965/66, den Dortmund durch einen 2:1-Sieg im Finale gegen den FC Liverpool gewann.
1. Runde
| Datum | Heimmannschaft | - | Gastmannschaft | Endergebnis |
| 16. Januar | Altonaer FC von 1893 | - | Hannover 96 | 0:5 |
| 16. Januar | VfR Frankenthal | - | VfB Stuttgart | 0:5 |
| 16. Januar | TSV Schwaben Augsburg | - | FC Schalke 04 | 5:7 n.V. |
| 16. Januar | 1. FC Nürnberg | - | 1. FC Köln | 2:0 |
| 16. Januar | Rot-Weiß Oberhausen | - | TSG Ulm 46 | 5:0 |
| 16. Januar | 1. FC Kaiserslautern | - | Karlsruher FV | 3:0 |
| 16. Januar | Westfalia Herne | - | Tennis Borussia Berlin | 3:4 n.V. |
| 16. Januar | Preußen Münster | - | Borussia Dortmund | 0:1 |
| 16. Januar | VfL Osnabrück | - | Alemannia Aachen | 1:3 |
| 16. Januar | 1. FSV Mainz 05 | - | Werder Bremen | 1:0 |
| 16. Januar | KSV Hessen Kassel | - | Hamburger SV | 0:2 |
| 16. Januar | SuS Northeim | - | Meidericher SV | 0:1 |
| 16. Januar | Eintracht Frankfurt | - | Borussia Neunkirchen | 2:1 |
| 16. Januar | VfL Wolfsburg | - | TSV 1860 München | 3:4 |
| 16. Januar | Kickers Offenbach | - | VfR Wormatia Worms | 2:4 |
| 16. Januar | Hertha BSC | - | Eintracht Braunschweig | 1:5 |
Achtelfinale
| Datum | Heimmannschaft | - | Gastmannschaft | Endergebnis |
| 6. Februar | Eintracht Frankfurt | - | FC Schalke 04 | 1:2 |
| 6. Februar | 1. FSV Mainz 05 | - | TSV 1860 München | 2:2 n.V. |
| 17. Februar | TSV 1860 München | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:2 (Wiederholungsspiel) |
| 6. Februar | Wormatia Worms | - | VfB Stuttgart | 0:2 |
| 6. Februar | 1. FC Nürnberg | - | Hamburger SV | 3:1 |
| 6. Februar | Meidericher SV | - | Eintracht Braunschweig | 0:1 |
| 6. Februar | 1. FC Kaiserslautern | - | Hannover 96 | 1:3 |
| 6. Februar | Tennis Borussia Berlin | - | Borussia Dortmund | 1:2 |
| 6. Februar | Rot-Weiß Oberhausen | - | Alemannia Aachen | 0:1 |
Viertelfinale
| Datum | Heimmannschaft | - | Gastmannschaft | Endergebnis |
| 27. Februar | Eintracht Braunschweig | - | Borussia Dortmund | 0:2 |
| 27. Februar | FC Schalke 04 | - | VfB Stuttgart | 4:2 |
| 27. Februar | Alemannia Aachen | - | Hannover 96 | 2:1 |
| 27. Februar | 1. FSV Mainz 05 | - | 1. FC Nürnberg | 0:3 |
Halbfinale
| Datum | Heimmannschaft | - | Gastmannschaft | Endergebnis |
| 7. April | Borussia Dortmund | - | 1. FC Nürnberg | 4:2 |
| 7. April | Alemannia Aachen | - | FC Schalke 04 | 4:3 n.V. |