1967 als Staatliches Neusprachliches und Mathematisch-Naturwissenschaftliches Gymnasium Bendorf gegründet, wurde es 1989 nach Wilhelm Remy benannt, einem der ersten deutschen Industriellen, der im 18. Jahrhundert in Bendorf wirkte.
In den 1970er Jahren unterhielt das Gymnasium ein Austauschprogramm mit der Thorpe St Andrew School im englischen Norwich. Seit 1978 besteht eine Schulpartnerschaft mit dem Collège Lelorgne de Savigny in Provins, Frankreich, und seit 1980 eine mit dem Radnóti Miklós Gymnasium in Szeged, Ungarn.
Im Jahr 2014 erhielt das Gymnasium aufgrund des Engagements im mathematisch-naturwissenschaftlichen Bereich die Auszeichnung als MINT-freundliche Schule.
Im Mai 2015 wurde das Wilhelm-Remy-Gymnasium als eine der ersten Schulen in Rheinland-Pfalz durch das Bildungsministerium zur Europaschule ernannt.
Seit 2021 ist die Schule iPad-Pilotschule des Landkreises, seit Ende 2022 können alle Lernenden iPads zur Nutzung im Unterricht ausleihen.[5]