Die VR Bank Weimar eG hat mehrere Wurzeln. Bereits 1871 wurde die Raiffeisenkasse eGmbHWeimar-Oberweimar gegründet. Im Jahre 2002 fusionierte die VR Bank Weimar eG zuletzt mit der Volksbank Raiffeisenbank Apolda eG mit dem Sitz in Apolda.
Die Volksbank Raiffeisenbank Apolda eG entstand im Jahr 1999 durch die Fusion der Raiffeisenbank Apolda e.G. mit der Volksbank Apolda e.G. (beide mit Sitz in Apolda). Zuvor fusionierten im Jahr 1998 die Raiffeisenbank Weimar eG. und die Volksbank Weimar e.G. (beide mit Sitz in Weimar) zur VR Bank Weimar eG.[3]