Die PukepukeLagoon befindet sich rund 3km östlich der Westküste, rund 13km nördlich von Foxton und rund 25km westlich von Palmerston North entfernt. Das rund 14,5Hektar große Gewässer, das sich über eine Länge von 555m in Nordwest-Südost-Richtung und über 375m in Südwest-Nordost-Richtung ausdehnt, ist von Nordwesten bis Nordosten und im Südwesten von einem Feuchtgebiet umgeben.[2][1]
Das Gewässer ist von allen Seiten mit landwirtschaftlich erzeugten kleinen Kanälen verbunden.[2]