Die West- und Ostteile der Neupokojew-Insel sind als niedrige, flache, sumpfige Ebenen von zahlreichen Seen bedeckt, die teils an den Ursprüngen der kurzen Fließgewässer liegen; die Gewässer sind die meiste Zeit des Jahres von Eis bedeckt. Im Mittelteil gibt es ein paar Hügel (max.29m[3] Höhe) aus quartären Ablagerungen. Westlich und südöstlich sind der Hauptinsel kleine längliche Inseln und Sandbänke vorgelagert.
Da die arktische Insel in der Vegetationszone Tundra liegt, beschränkt sich die Vegetation auf Moose, Flechten und Gräser. Die Winter sind lang und extrem kalt, die Sommer kurz und kalt. Es herrscht Permafrostboden vor, der in den Sommern zunehmend mehr antaut.
↑Topographische Karte (Memento vom 12. März 2005 im Internet Archive) (1:200.000, Bl.S-43-XXIX,XXX, Ausg. 1956), Neupokojew-Insel (oben links) in der Karasee u.a. mit Nachbarinseln und Sandbänken, auf maps43.narod.ru (mit Höhen über Meer)