Der Lake Clarke befindet sich in den Thomson Range, rund 2,7km westlich des ArawhataRiver und rund 4,5km südöstlich des Jackson River. Der höchste Gipfel der Bergkette, der 1189m hohe Mount Jackson, liegt 1,24km nordöstlich des Sees und der Nachbarsee Lake Leeb 815m südwestlich. Mit einer Flächenausdehnung von 25,6Hektar erstreckt sich der auf einer Höhe von 906m liegende Lake Clarke über eine Länge von 1,095km in Südsüdost-Nordnordwest-Richtung und misst an seiner breitesten Stelle 335m. Der Umfang des Sees liegt bei rund 2,72km.[1][2]
Der See verfügt über keine erkennbaren Zuflüsse. Die Entwässerung des Lake Clarke findet bei genügend Wasserstand an seinem nördlichen Ende über den Cart Creek statt, der weiter nordnordwestlich in den Jackson River mündet.[1][2]
