Der Verein wurde 2015 als Bangkok U. Deffo FC gegründet. 2018 erfolgte die Umbenennung in Deffo FC. Der Verein startete in der dritten Liga, der Regional League Division 2. Hier startete man in der Region Bangkok. Mit Eintreten der Ligareform 2017 spielt der Verein ebenfalls in der dritten Liga, der heutigen Thai League 3. Seit 2017 spielt der Verein in der Lower-Region. Ende 2018 musste der Verein den Weg in die Viertklassigkeit antreten. Nach dem Abstieg wurde der Verein in Rangsit United FC umbenannt. Ein Jahr später erhielt er seinen heutigen Namen Inter Bangkok FC. Wegen der COVID-19-Pandemie wurde die Saison 2020 nach dem zweiten Spieltag abgebrochen. Während der Unterbrechung wurde vom Verband beschlossen, dass nach Wiederaufnahme des Spielbetriebs die dritte- und die vierte Liga zusammengelegt werden. Ab der Saison 2020/21 spielte der Verein in der dritten Liga. Bis zum Ende der Spielzeit 2023/24 spielte der Verein in der Bangkok Metropolitan Region. Zu Beginn der Spielzeit wechselte man in die Central Region. Im Sommer 2025 wurde dem Verein die Lizenz für die dritte Liga verweigert. Die Saison 2026 startet man in der vierten Liga, der Thailand Semi-Pro League.
Der Verein trägt seine Heimspiele im 72nd Anniversary Stadium (Min Buri) im Bangkoker Bezirk Min Buri aus. Das Stadion hat ein Fassungsvermögen von 10.000 Personen. Besitzer des Stadions ist die Stadt Bangkok.