Basaltiviridae
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Virion vorhergesagt spindelförmiger Archaeenviren | ||||||||||||||||
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Basaltiviridae (auch Basaltviridae[2] ist eine Familie spindelförmiger Archaeenviren. Die Familie wurde vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) am 20. März 2026 mit der Master Species List MSL #41v1 offiziell bestätigt. Sie beinhaltet derzeit (Stand 9. April 2026) monotypisch nur eine einzige Spezies, Tsigisvirus. Die Familie hat derzeit incertae sedis noch keine Zuweisung zu einem Virus-Realm.[3][1]
Beschreibung
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Die Familie Basaltiviridae umfasst spindelförmige dsDNA-Viren mit zwei vollständig sequenzierten Vertretern, JdFR013 (Tsigisvirus orcuttae) und JdFR006 (Tsigisvirus beckeri), die per Clusteranalyse derselben Gattung Tsigisvirus zugeordnet sind. Diese Viren besitzen zirkuläre Genome mit einer Länge von ca. 13 kbp. Die meisten der in diesen Genomen kodierten Proteine weisen zwar keine Homologie zu anderen bekannten Viren aufwiesen, konnten mithilfe von HHpred-Funktionsvorhersagen[A. 1] einige virusspezifische Strukturproteine identifiziert werden:
- das Hauptkapsidprotein (vp1),
- das mit der DNA-Bindung assoziierte Kapsidprotein (vp2) und
- Protein der Endfilamente (vp4).[A. 2]
Ähnlich wie andere spindelförmige Viren enthalten auch diese Genome der Basaltiviridae Integrasen. Obwohl bisher (Stand April 2026) die Wirte der meisten spindelförmigen Viren nicht genauer als bis auf die oberste Rangstufe identifiziert werden konnte (nämlich die Domäne der Archaeen), wurde JdFR006 als Prophage innerhalb einer Spezies von Bathyarchaeen-Art in den mikrobiellen Metagenomen aus der Fund-Umgebung identifiziert.[3]
Details
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Die Basaltiviridae sind spindelförmige Archaeenviren. Ihre beiden Gründungsmitglieder sind:[3]
- Bathyarchaeen-Virus JdFR006 (Bathyarchaeota virus JdFR006)
- Wirt: nicht näher identifizierte Bathyarchaeen Bathyarchaeota
- Genomlänge: 13.970 bp (Basenpaare)
- Archaeen-Virus JdFR013 (Archaeal virus JdFR013)
- Wirte: nicht identifizierte Archaeen
- Genomlänge: 13.328 bp
Fundort beider Vertreter: marines Metagenom (MAG) aus in Basalt eingeschlossenem Krustenfluid (englisch basalt-hosted crustal fluid) von der Flanke des Juan-de-Fuca-Rückens (JdFR), Nordostpazifik (Probenentnahme am 21. August 2014).[5][6][7]
Systematik
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Die Systematik der Familie Basaltiviridae ist mit Stand 9. April 2026 wie folgt:[8]
Familie Basaltiviridae
Etymologie
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Namensherkunft gemäß (angenommenem) Vorschlag an das ICTV:[3]
- Basaltiviridae
– von lateinisch basaltis ‚Basalt‘, in Anlehnung an die Umgebung, in der die beiden ersten (und bis April 2026 einzigen) Mitglieder dieser Familie gefunden wurden; versehen mit der Virusfamilien kennzeichnenden Endung ‚-viridae‘. - Tsigisvirus
– abgeleitet vom Quatsino[A. 3]-Wort „Tsigis“, das in deren Mythologie ein Ungeheuer der Tiefsee bezeichnet, und zudem auf den Namen des geplanten Meeresschutzgebiets (Marine Protected Area, MPA) verweist, in dem sich die Probenahmestellen befinden
- Beide haben maßgeblich zur Weiterentwicklung der CORK-Instrumente (englisch Circulation Obviation Retrofit Kit[9]) und zur Erforschung des Tiefsee-Untergrunds, insbesondere am JdFR, beigetragen.[3]
Anmerkungen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ HHpred ist ein Online-Server zur Vorhersage von Proteinstrukturen, der Homologieinformationen aus der HH-Suite nutzt. HH-Suite ist ein Open-Source-Softwarepaket für die Suche nach sensiblen Proteinsequenzen.[4]
- ↑ Die spindelförmigen Viruspartikel (Virionen) haben an ihren Filamente (faserige Anhängsel an den Spindelenden).
- ↑ Quatsino First Nation (ein Volk der Ureinwohner)
Einzelnachweise
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Master Species Lists (MSL). Abgerufen am 8. April 2026.
- ↑ ICTV: Viruses infecting archaea (4) dsDNA: predicted spindle-shaped: Basaltviridae. Memento im Webarchiv vom 9. April 2026. Offensichtlich Fehlschreibung.
- 1 2 3 4 5 ICTV: 2025.001A.Crust_viruses_6nf. Mit:
- ↑ J. Söding, A. Biegert, A. N. Lupas: The HHpred interactive server for protein homology detection and structure prediction. In: Nucleic Acids Research. 33. Jahrgang, 2005, S. W244–W248, doi:10.1093/nar/gki408, PMID 15980461, PMC 1160169 (freier Volltext) – (englisch).
- 1 2 3 Cherise Spotkaeff, Michael Rappe, Sean Jungbluth, Grieg F. Steward, Olivia Nigro: Phylogenomic Analysis of Viral Genomes Assembled from Juan de Fuca Ridge Flank Basalt-Hosted Crustal Fluids In: Conference: Goldschmidt, Januar 2020; doi:10.46427/gold2020.2448, ResearchGate:345188815 (englisch).
- 1 2 NCBI Nucleotide: Bathyarchaeota virus JdFR006, Accession: PQ111734.
- 1 2 NCBI Nucleotide: Archaeal virus JdFR013, Accession: PQ111735.
- ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR). Abgerufen am 8. April 2026.
- ↑
K. Becker, E. E. Davis: A review of CORK designs and operations during the Ocean Drilling Program. In: A. T. Fisher, T. Urabe, A. Klaus et al.: Proc. IODP, 301: College Station TX (Integrated Ocean Drilling Program Management International, Inc.), 31 Oktober 2005; doi:10.2204/iodp.proc.301.104.2005 (englisch). Dazu:
- Laura Guertin, Elizabeth Doyle, Tessa Peixoto: 5.7 Circulation Obviation Retrofit Kits (CORKs). In: Scientific Ocean Drilling: Exploration and Discovery through Time. Pennsylvania State University (PennState, psu.pb.unizin.org), 2025.
