Genom
Genom bezeichnet die Gesamtheit der Erbanlagen eines Lebewesens.
Bestandteile und Genomgröße
Das Genom kann in kodierende und nicht-kodierende Sequenzen eingeteilt werden. Gene stellen dabei die DNA-Abschnitte dar, die die Erbinformation für ein bestimmtes Protein enthalten. Daneben gibt es DNA-Abschnitte, die der Genregulation dienen. Pseudogene sind durch Mutationen funktionslos gewordene und vom Organismus nicht mehr abgelesene Gene. Bei Eukaryonten findet duch das alternative Splicing eine Datenkompression statt, so dass die Genomgröße (in Basenpaaren gemessen) kleiner sein kann als die Anzahl der durch das Genom codierten Merkmale.
Bei allen Organismen, die komplexer als Viren sind, gibt es außerhalb der chromosomalen DNA weitere Genombestandteile in anderen Zellteilen. So finden sich bei Bakterien und Archaebakterien Plasmide, bei Eukaryonten (Pflanzen, Tiere, Pilze) gibt es selbstständig vererbte Genome in den Mitochondrien und Plastiden, die aber zum Gesamtgenom der Zellen gehören.
Typische Genomgrößen
Lebewesen | Genomgröße (in Basenpaaren) |
---|---|
λ-Phage | 5×104 |
Darmbakterium E. coli | 4×106 |
Bäckerhefe | 2×107 |
Fadenwurm C. elegans | 8×107 |
Taufliege Drosophila melanogaster | 2×108 |
Mensch | 3×109 |
Molch | 4×1010 |
Anmerkung : Die DNA einer einzelnen menschlichen Zelle ist ca. 1,80 m lang.
Auffallend ist, dass die Genomgröße anscheinend nicht mit der Komplexität oder Organisationsstufe des Organimus korreliert ist: Ein Molch ist nicht zehnmal komplexer aufgebaut als ein Mensch. Dieser scheinbar paradoxe Nicht-Zusammenhang wird "C-Wert Paradoxon" genannt. Er löst sich auf, wenn man in Betracht zieht, dass nur ein Bruchteil der DNA von Eukaryonten kodierend ist, außer den Genen auch Transposons im Genom mitgeführt werden, die vielfältige Duplikationen hervorrufen und einzelne Gene verschiedene Spleißvarianten besitzen können.
Sequenzierte Genome im Internet
Mittels DNA-Sequenzierung wurde annähernd vollständig Genome von verschiedenen Organismen, die entweder für die medizinisch-pharmazeutische anwendungsorientierte oder auch für die Grundlagenforschung relevant sind, ermittelt und über das Internet vom NCBI bereitgestellt.
- Archaea - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/static/a.html
- Bacteria - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/static/eub.html
- Escherichia coli (Colibakterien) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=562
- Eukaryota - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/static/euk.html
- Homo sapiens (Mensch) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=9606
- Felis catus (Hauskatze) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=9685
- Mus musculus (Hausmaus) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=10090
- Drosophila melanogaster (Fruchtfliege) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=7227
- Arabidopsis thaliana (Ackerschmalwand) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=3702
- Oryza sativa (Reis) - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=4530
Siehe auch: Genetik - Molekularbiologie - Proteinbiosynthese - DNA-Sequenzanalyse