Die Gauliga Sachsen 1938/39 war die sechste Spielzeit der Gauliga Sachsen im Fußball. Die Meisterschaft sicherte sich der Dresdner SC mit einem Punkt Vorsprung vor der Mannschaft des VfB Leipzig. Der Dresdner SC qualifizierte sich für die Endrunde um die Deutsche Meisterschaft und belegte dort den 3.Platz. In dieser Spielzeit gab es keine Absteiger, da die Liga aufgestockt wurde. Aus den Bezirksligen stiegen der VfB Glauchau und der Chemnitzer BC auf.
