Benutzer:Ernsts/Kandidaten

* = neu, sonst übersetzt mit den angegebenen Quellen

V = Viren, B = Bakterien, A = Archaeen, P = Protisten inkl. Mikropilze, O = sonstige zelluläre Organismen, G = Geologie/Geographie/Ozeanologie/Limnologie, W = Weltraum/Astronomie, X = andere

• V ViralZone: neue Artikel, neue Bilder

• B Benutzer:Ernsts/Zetaproteobacteria en:Zetaproteobacteria

• X Benutzer:Ernsts/Oca-Bckn en:Orca Basin

• B es:Calescamantes (NCBI) = Calescibacterota (GTDB) = EM19: Gattung Calescibacterium + KB1 group
  • NCBI Tax:Calescamantes (tree), Candidatus Calescamantes Rinke et al. 2013 = candidate division EM19;
  • GTDB:Phylum Calescibacterota
  • "Nigro2016": Lisa M. Nigro, Andrew S. Hyde, Barbara J. MacGregor, Andreas Teske: Phylogeography, Salinity Adaptations and Metabolic Potential of the Candidate Division KB1 Bacteria Based on a Partial Single Cell Genome. In: Frontiers in Microbiology, Band 7, Sec. Extreme Microbiology, 22. August 2016; doi:10.3389/fmicb.2016.01266.
  • "Eder1999": Wolfgang Eder, Wolfgang Ludwig, Robert Huber: Novel 16S rRNA gene sequences retrieved from highly saline brine sediments of Kebrit Deep, Red Sea. In: Archives of Microbiology, Band 172, Nr. 4, September 1999, S. 213–821; doi:10.1007/s002030050762, PMID 10525737, Epub Oktober 1999 (englisch). Zu KB1 siehe insbes. Fig. 1.
  • "Eder2001": Wolfgang Eder, Linda L. Jahnke, Mark Schmidt, Robert Huber: Microbial Diversity of the Brine-Seawater Interface of the Kebrit Deep, Red Sea, Studied via 16S rRNA Gene Sequences and Cultivation Methods. In: Applied and Environmental Microbiology. 67. Jahrgang, Nr. 7, 1. Juli 2001, ResearchGate: 11914373, S. 3077​–3085, doi:10.1128/AEM.67.7.3077-3085.2001, PMID 11425725, PMC 92984 (freier Volltext), bibcode:2001ApEnM..67.3077E (englisch).  Zu KB1 siehe insbes. Fig. 5.
  • NCBI Tax: uncultured bacterium 'KTK 32', Nucleotide: AJ133617

• B Benutzer:Ernsts/Taurinivorans muris https://scitechdaily.com/a-foul-smelling-savior-how-a-new-gut-microbe-fights-dangerous-pathogens/

• B Acidobacteriota, NCBI Acidobacterota, Acidobacterium capsulatum, en:Bryobacteraceae, Solibacteraceae, Ca. Sulfopalufibacter, NCBI MAG SbA3, SciTechDaily, doi:10.1038/s41467-023-42074-z, doi:10.1093/femsre/fuad058, DSMZ!

• B Pseudomonas stutzeri syn. Stutzerimonas stutzeri

  • Stutzerimonas stutzeri syn. Pseudomonas stutzeri syn. "Bacterium stutzeri" Lehmann & Neumann 1896 **: LPSN

    doi:10.3389/fmicb.2016.00102 Wu2016 (CC BY 4.0 Deed)

• B Aquabacterium en:Aquabacterium Aquabacteria=Burkholderiaceae_B (GTDB), siehe Eleftheria terrae. <> Aquabacterium terrae (Ref'stamm S2) = Aquincola sp. S2

• B Rippkaea monotypisch R. orientalis, siehe Cyanothece NCBI LPSN

• B en:Allorhizobium mit en:Allorhizobium vitis siehe Agrobacterium

• B Trichodesmium (Cyanobacteria) + Alphaproteobacteria https://www.eurekalert.org/news-releases/1007368 https://www.eurekalert.org/news-releases/1007368?language=german doi:10.1038/s41467-023-42304-4

• B Candidatus Hinthialibacterota = Phylum OLB16 group = Candidatus Hinthialibacteria bacterium OLB16 SciTechDaily, NCBI Tax LPSN doi:10.1111/1462-2920.16543

• A Archaeglobus en:Archaeglobus
• A Benutzer:Ernsts/Thermococcus en:Thermococcus Virus Thermococcus waiotapuensis
• A Benutzer:Ernsts/Halococcus hamelinensis en:Halococcus hamelinensis bilden Stromatolithen en:Stromatolite#Saline locations
• P en:Mesotaenium Mesotaenium endlicherianum SciTechDaily
• P Benutzer:Ernsts/Oligohymenophorea en:Oligohymenophorea doi:doi:10.1371/journal.pgen.1010913 https://scitechdaily.com/divergent-dna-the-accidental-discovery-thats-shaking-genetics/
• P Benutzer:Ernsts/Mesotaenium endlicherianum https://www.eurekalert.org/news-releases/1000143?language=german einzellige Alge Mesotaenium endlicherianum, ein Vertreter der engsten Verwandten der Landpflanzen en:Mesotaenium (Jochalgen)
• P Benutzer:Ernsts/Perkinsela en:Perkinsela
• P Benutzer:Ernsts/Micrasterias en:Micrasterias en:Micrasterias furcata bdw
• P Nitzschia en:Nitzschia Nitzschia reversa, host diatom for NitRevRNAV Datei:Nitzschia-kerguelensis hg.jpg
• P Benutzer:Ernsts/Mesodinium rubrum en:Mesodinium rubrum
• P Benutzer:Ernsts/Mesodinium chamaeleon en:Mesodinium chamaeleon da:Mesodinium chamaeleon NewScientist
• P Benutzer:Ernsts/Braarudosphaera bigelowii en:Braarudosphaera bigelowii Bakt. Symb.
• P Benutzer:Ernsts/Hemiaulus en:Hemiaulaceae siehe en:Riedelia (diatom) Hemiaulus membranaceus Cleve 1873 - Algaebase Hemiaulus sinensis — diark Hemiaulus. Spesies. : H. hauckii
• P Benutzer:Ernsts/Climacodium *? (en:Hemiaulaceae), en:Pulicat Lake/Pulicat-See: Climacodium frauenfeldianum, Symbiose mit Crocosphaera, Taxonomie: en:Hemiaulaceae
• P Benutzer:Ernsts/Sphaerophrya * https://commons.wikimedia.org/wiki/File:EB1911_Infusoria_-_Suctoria-12.jpg siehe dort
• P Licmophora * sdw 9/22 Das Rätsel des Schwefelkreislaufes fr:Licmophorales (Bild) File:Licmophora sp.jpg Bild NCBI File:File:Licmophora flabellata-Haeckel.jpg Bild Bilderkategorie
• P en:Licnophora NCBI
• P Benutzer:Ernsts/Vampirococcus lugosii en:Vampirococcus [nature]
• P Jullienella foetida orf.at, idw
• P en:Fonticula
• P en:Apusozoa
• V Intestiviridae * ViralZone
• V Leisingerviridae * ViralZone
• V Pleurochrysis endemic virus
• O en:Diadema antillarum USF, n-tv, SdW, Welt, NCBI Nucleotide Wimpertiweercheen Philasterida sp. isolate FWC2_3 en:https://en.wikipedia.org/wiki/Philasterida aka Philaster apodigitiformis doi:10.1017/S1477200009990193 cf. en:Miamiensis avidus
• X Benutzer:Ernsts/Hartman-Effect en:Hartman effect

2. Wahl, themenbezogen

Archaeen

• ARMAN Benutzer:Ernsts/ARMAN en:Archaeal Richmond Mine acidophilic nanoorganisms fr:ARMAN (kein Taxon/Klade ⇒ Cluster 1)

Bakterien

• Staphylococcus aureus Update zu MRSA
• PAUC34f https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2020.00376/full Hiding in Plain Sight: The Globally Distributed Bacterial Candidate Phylum PAUC34f
• Terrabacteria Benutzer:Ernsts/Terrabacteria en:Terrabacteria
• en:Katanobacteria
• en:Wirthbacteria
• en:Nomurabacteria
• en:Berkelbacteria
• en:Fertabacteria
• en:Microgenomates
• en:Poribacteria
• en:Orbales

Viren

1. Partitiviridae
2. Polymycoviridae
3. Avsunviroidae
4. Pospiviroidae
5. Pararnavirae
6. Belpauviridae
7. Metaviridae
8. Pseudoviridae
9. Miaviricete
10. Leviviricetes
11. Naryaviridae (CRESS) https://www.nature.com/articles/s41467-020-18474-w (Five CRESS virus families have experimentally confirmed eukaryotic hosts: Bacilladnaviridae, Circoviridae, Geminiviridae, Genomoviridae, and Nanovirid
12. Nenyaviridae (dito)
13. Vilyaviridae (dito)
14. Benutzer:Ernsts/Blumeviridae es:Blumeviridae en:Blumeviridae A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy Suppl. 1, https://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/prokaryote-official/12298/download https://talk.ictvonline.org/files/ratification/m/proposals-for-ratification/11003
15. Benutzer:Ernsts/Steitzviridae es:Steitzviridae en:Steitzviridae dito
16. Mesyanzhinovviridae dito
17. Casjensviridae dito
18. Zierdtviridae dito
19. Intestiviridae dito
20. Steigviridae dito
21. Suoliviridae dito
22. Crevaviridae dito
23. Matshushitaviridae dito
24. Simuloviridae dito
25. Paulinoviridae dito
26. Tupavirus
27. Phlebovirus
28. Toursvirus Benutzer:Ernsts/Toursvirus
29. Acute bee paralysis virus Akutes Bienenparalysevirus Benutzer:Ernsts/Acute bee paralysis virus en:List of diseases of the honey bee#Acute bee paralysis virus
30. Varroa destructor iflavirus 1 Benutzer:Ernsts/Varroa destructor virus Siehe en:List of diseases of the honey bee#Deformed wing virus
31. A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy Suppl. 1, https://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/prokaryote-official/12298/download https://talk.ictvonline.org/files/ratification/m/proposals-for-ratification/11003:(?)Mesyanzhinovviridae, (?)Kwiatkowskiviridae, Caudovirales:Schitoviridae, (?)Casjensviridae, (?)Zierdtviridae, Crassvirales:Intestiviridae, Crassvirales:Steigviridae, Crassvirales:Suoliviridae,Crassvirales:Crevaviridae, Crassvirales:Jelitoviridae, Crassvirales:Tinaiviridae, Norzivirales/Levivirales:Fiersviridae/Leviviridae, Halopanivirales:Matshushitaviridae+Simuloviridae, Timlovirales:Steitzviridae, Tubulavirales:Paulinoviridae,
32. ebenda, sowie in: Lak megaphage Megaphages infect Prevotella and variants are widespread in gut microbiomes. Nat. Microbiol. 2019, 4, andere Megaphages/Huge Phages Clades of huge phages from across Earth’s ecosystems Prevotella phage Lak megaphage
33. Cyanophage S-2L NCBI ScienceAlert Noncanonical DNA polymerization by aminoadenine-based siphoviruses A third purine biosynthetic pathway encoded by aminoadenine-based viral DNA genomes A widespread pathway for substitution of adenine by diaminopurine in phage genomes
34. Phage MIJ3 Frontiers CC-BY mit Photos
35. Pseudomonas virus 42 Benutzer:Ernsts/Pseudomonas virus 42 en:Pseudomonas virus 42 Pseudomonas virus 42 Appl Environ Microbiol.: High Diversity and Novel Species of Pseudomonas aeruginosa Bacteriophages Pseudomonas virus 42 Wikispecies:Pseudomonas virus 42 Tevenvirinae
36. Egypt bee virus Benutzer:Ernsts/Egypt bee virus Siehe en:List of diseases of the honey bee#Deformed wing virus
37. Lake Sinai Virus 1 bis 7 Benutzer:Ernsts/Lake Sinai Virus bzw. Gattung Sinaivirus en:List of diseases of the honey bee#Lake Sinai virus Lake Sinai, USA
38. Darwin bee virus 1 bis 8 Benutzer:Ernsts/Darwin bee virus
39. Tulip-breaking-Virus Benutzer:Ernsts/Tulip-breaking-Virus en:Tulip breaking virus
40. Petersilien-Y-Virus (= Unterart von Apium virus Y = Sellerie-Virus Y ???)
41. Pleurochrysis sp. endemic virus 1a, 1b, 2, ... NCBI:Pleurochrysis endemic viruses [1] J. Martinez Martinez, I. C. Gilg, E. Lyczkowski, M. Krupovic, E. V. Koonin, W. H. Wilson:Persistent co-infection of the coccolithophorid Pleurochrysis carterae by three virus groups
42. Salmonella virus Chi Benutzer:Ernsts/Salmonella virus Chi Siphoviridae
    -------------------------
43. Enterobacteria-Phage phi80 Benutzer:Ernsts/Enterobacteria-Phage phi80 (Siphoviridae; nicht Yersinia virus Phi80-18, Autographiviridae)
44. Bacillus-Phage Gamma Siphoviridae Gattung Wbetavirus (alias Wbetalikevirus)
45. Bakteriophage CS112 (ΦCS112) Scharlach wie T12, RG235932681 PMC515249 PMC161974
46. Adomaviridae Nicole L. Welch, Natalya Yutin et al.: Adomaviruses: an emerging virus family provides insights into DNA virus evolution, in: bioRxiv, 7. Juni 2018 bioRxiv: 2018/06/07/341131 (Preprint-Volltext), doi:10.1101/341131, insbes. Fig. 7, Nicole L. Welch, Michael J. Tisza et al.: Identification of “Missing Link” Families of Small DNA Tumor Viruses, in: BioRxiv; Cold Spring Harbor, 11. Juli 2019, bioRxiv: 10.1101/697771v3 (Preprint-Volltext), NCBI: Adomaviridae (family) Identification of Adomavirus Virion Proteins
47. Clostridium botulinum phages https://oparu.uni-ulm.de/xmlui/bitstream/handle/123456789/3000/vts_8708_12945.pdf?isAllowed=y&sequence=1, https://www.researchgate.net/publication/23072048_Observations_on_bacteriophages_of_Clostridium_botulinum_type_C_isolates_from_different_sources_and_the_role_of_certain_phages_in_toxigenicity, https://viralzone.expasy.org/3967, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=12336 Clostridium botulinum phage C strain Stockholm
48. Bakteriophagen P1 en:P1 phage P1 Artificial Chromosome
49. Phage TSST-1 Benutzer:Ernsts/Phage TSST-1 RG235932681
50. Aureococcus anophagefferens virus Benutzer:Ernsts/Aureococcus anophagefferens virus Brown Tide Virus Genome of brown tide virus (AaV)
    -------------------------
51. Staphylococcus aureus phage PS42-D Enterotoxin A Ref.