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Mimiviridae

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Mimiviridae
Systematik
Klassifikation: Viren
Ordnung: 'Megavirales'
Familie: Mimiviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear nicht-segmentiert
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: komplex
Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Mimiviridae

Mit dem Begriff Mimiviridae wird eine Familie von ds-DNA-Viren bezeichnet. Die Viren dieser Familie gehören zu der Klade der Nucleocytoplasmic large DNA viruses (NCLDV), ebenso wie die Mitglieder der Familien Asfarviridae (inklusive Dinodnavirus), Iridoviridae (inklusive der Ascoviren), Phycodnaviridae (inklusive der Pandoraviren und Mollivirus), Marseilleviridae, Pithoviridae und Poxviridae.

Forschungsgeschichte

Das erste Mitglied dieser Familie, das Mimivirus wurde bereits 2003 entdeckt.[1] Weitere Mitglieder der Familie sind Cafeteria-roenbergensis-Virus, Courdovirus, Mamavirus, Moumouvirus, Terravirus 1, Terravirus 2, Klosneuvirus[2] und Tupanvirus.[3][4][5][6]

Außerdem wurde vorgeschlagen, die Familie Mimiviridae um eine weitere Gruppe zu erweitern, die zunächst der Familie der Phycodnaviridae als OLPG (Organic Lake Phycodna Group) zugeordnet worden war. Da diese Gruppe jedoch eher mit Mimiviridae verwandt zu sein scheint, wäre sie stattdessen als Unterfamilie Mesomimivirinae zu den Mimiviridae zu stellen. Damit wären die Mesomimivirinae die Schwestergruppe zur Unterfamilie der herkömmlichen Mimiviren (inklusive Megavirus chilensis), für die dann der Name Megavirinae (z. T. auch Megamimivirinae) vorgeschlagen wurde. Die so erweiterte Familie der Mimiviridae wird bei manchen Autoren auch als Megaviridae bezeichnet.[3][7][8][9]

Im November 2018 berichteten Frederik Schulz und Kollegen über die Entdeckung von 16 neuen Riesenviren per Metagenomanalyse von Waldbodenproben. Für diese Viren wurden vorläufige Namen vergeben, die meist auf ihre Herkunft hinweisen. Zur Familie der Mimiviridae, Unterfamilie Megamimivirinae scheinen davon die folgenden zu gehören: Faunusvirus, Gaeavirus, Homavirus, Indivirus, Barrevirus, Edafosvirus, Hyperionvirus, Harvfovirus, Terrestrivirus, Dasosvirus und Satyrvirus.[9]

Taxonomie

Obwohl erst einige wenige Mitglieder dieser Familie im Detail beschrieben sind, erscheint es als wahrscheinlich, dass es weitere Virusarten gibt, die in diese Gruppe gehören.[10][11] Dazu gehören Chrysochromulina ericina virus 01, Phaeocystis pouchetii virus 01 und Pyramimonas orientalis virus 01. Diese Viren sind bereits isoliert aber noch nicht ausreichend charakterisiert.

Die folgende innere Systematik beruht wo nicht anders angegeben auf einem Vorschlag von Schulz et al. 2018[9] zur Ergänzung der ICTV-Nomenklatur.[12] Die von diesem aus der Metagenomanalyse von Waldboden stammenden Kandidaten sind grün wiedergegeben. Die Mimiviridae ohne Mesomimivirinae (d. h. vor Hinzufügen der OLPG) sind ad hoc als ‚Mimiviridae s. s.‘ referenziert.

 Mimiviridae (aka Megaviridae) 
 Mimiviridae s. s.[13] 

 Klosneuvirinae[14] 


Gaeavirus


   

Homavirus, Klosneuvirus, Indivirus, Barrevirus


   

Edafosvirus, Catovirus, Hyperionvirus, Harvfovirus, Terrestrivirus, Dasosvirus, Bodo saltans virus (BsV)




   

Hokovirus



 Megamimivirinae (aka Megavirinae, Mimiviridae Gruppe I)[16] 
 A (Mimivirus-Gruppe)[15] 

Mimivirus, Mamavirus,...


 


 

 B (Moumouvirus-Gruppe) 

Moumouvirus, Ochan-Virus,...


 C (Courdo11-Virus-Gruppe) 

Megavirus, Courdo7, Courdo11,...




   

Tupanvirus


   

Satyrvirus






 CroV-Subfamilie (Mimiviridae Gruppe II) 

Cafeteria roenbergensis Virus (CroV)


   

Faunusvirus




 Mesomimivirinae (Mimiviridae Gruppe III, ehem. OLPG)[19] 

Phaeocystis globosa Virus (PgV), Phaeocystis pouchetii Virus (PpV)


   

"Organic Lake Phycodnavirus" 1 and 2 (OLV1, OLV2)


   

Yellowstone Lake Mimivirus (ehem. "Yellowstone Lake Phycodnavirus" 4)


   

Chrysochromulina ericina virus (CeV)


   

Aureococcus anophagefferens virus (AaV)


   

Pyramimonas orientalis virus (PoV)


   

Tetraselmis virus (TetV-1)[17][18]


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Commons: Mimiviridae – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien

Einzelnachweise

  1. M. Suzan-Monti, B. La Scola, D. Raoult: Genomic and evolutionary aspects of Mimivirus. In: Virus Res. 117(1), 2006, S. 145–155.
  2. Frederik Schulz, Natalya Yutin, Natalia N. Ivanova, Davi R. Ortega, Tae Kwon Lee, Julia Vierheilig, Holger Daims, Matthias Horn, Michael Wagner: Giant viruses with an expanded complement of translation system components. In: Science. 356. Jahrgang, Nr. 6333, 7. April 2017, ISSN 0036-8075, S. 82–85, doi:10.1126/science.aal4657, PMID 28386012 (englisch, sciencemag.org).
  3. a b Jônatas Abrahão, Lorena Silva, Ludmila Santos Silva, Jacques Yaacoub Bou Khalil, Rodrigo Rodrigues, Thalita Arantes, Felipe Assis, Paulo Boratto, Miguel Andrade, Erna Geessien Kroon, Bergmann Ribeiro, Ivan Bergier, Herve Seligmann, Eric Ghigo, Philippe Colson, Anthony Levasseur, Guido Kroemer, Didier Raoult, Bernard La Scola: Tailed giant Tupanvirus possesses the most complete translational apparatus of the known virosphere. In: Nature Communications. 9. Jahrgang, Nr. 1, 27. Februar 2018, doi:10.1038/s41467-018-03168-1 (nature.com).
  4. Daniel Lingenhöhl: Verschieben neue Riesenviren die Grenzen des Lebens?, auf: Spektrum.de vom 28. Februar 2018
  5. Nadja Podbregar: Ungewöhnliche Riesenviren entdeckt, auf: wissenschaft.de vom 27. Februar 2018
  6. Riesenviren an der Grenze zum Leben, auf: scinexx.de vom 28. Februar 2018
  7. Natalya Yutin et al.: Origin of giant viruses from smaller DNA viruses not from a fourth domain of cellular life, in: Virology Volumes 466–467, Oktober 2014, P. 38-52, doi: 10.1016/j.virol.2014.06.032
  8. Carolina Reyes, Kenneth Stedman: Are Phaeocystis globosa viruses (OLPG) and Organic Lake phycodnavirus a part of the Phycodnaviridae or Mimiviridae?, Blog auf ResearchGate, 8. Januar 2016
  9. a b c Frederik Schulz, Lauren Alteio, Danielle Goudeau, Elizabeth M. Ryan, Feiqiao B. Yu, Rex R. Malmstrom, Jeffrey Blanchard, Tanja Woyke: Hidden diversity of soil giant viruses, in: Nature Communicationsvolume 9, Article number: 4881 (2018) vom 19. November 2018, doi:10.1038/s41467-018-07335-2
  10. E. Ghedin, J. M. Claverie: Mimivirus relatives in the Sargasso sea. In: Virol J. 2, 2005, S. 62.
  11. A. Monier, J. M. Claverie, H. Ogata: Taxonomic distribution of large DNA viruses in the sea. In: Genome Biol. 9(7), 2008, S. R106.
  12. ICTV: Virus Taxonomy.
  13. Colson P, Fournous G, Diene SM, Raoult D (2013) Codon usage, amino acid usage, transfer RNA and amino-acyl-tRNA synthetases in mimiviruses. Intervirology 56(6):364-375. doi:10.1159/000354557
  14. Frederik Schulz, Natalya Yutin, Natalia N. Ivanova, Davi R. Ortega, Tae Kwon Lee, Julia Vierheilig, Holger Daims, Matthias Horn, Michael Wagner: Giant viruses with an expanded complement of translation system components. In: Science. 356. Jahrgang, Nr. 6333, 7. April 2017, ISSN 0036-8075, S. 82–85, doi:10.1126/science.aal4657, PMID 28386012, bibcode:2017Sci...356...82S (englisch, sciencemag.org)., UCPMS ID: 1889607, PDF
  15. Morgan Gaia et al.: Zamilon, a Novel Virophage with Mimiviridae Host Specificity, in: PLoS One. 2014; 9(4): e94923. Published online 2014 Apr 18. doi: 10.1371/journal.pone.0094923
  16. Siehe auch Abrahão et al. (2018), Fig. 4 auf S. 5
  17. A new giant virus found in the waters of Oahu, Hawaii, ScienceDaily, 3. Mai 2018
  18. Christopher R. Schvarcz, Grieg F. Steward: A giant virus infecting green algae encodes key fermentation genes. Virology, 2018; 518: 423 DOI: 10.1016/j.virol.2018.03.010
  19. Weijia Zhang et al.: Four novel algal virus genomes discovered from Yellowstone Lake metagenomes, in: Scientific Reports 5, Article number: 15131 (2015), especially Figure 6, doi:10.1038/srep15131