Sekundäre Kosten sind Kosten, die durch Verbrauch innerbetrieblicher Leistungen entstehen. Es sind Kosten die in sogenannten Hilfskostenstellen (beispielweise Kantine, die betriebseigenen Stromerzeugung oder Reparaturwerkstatt) anfallen und per innerbetrieblichen Leistungsverrechnung auf Hauptkostenstellen verrechnet werden. Für die Hauptkostenstellen sind diese Kosten Sekundäre Kosten.
Der Preis mit dem die sekundären Kosten auf die verbrauchenden Kostenstellen verrechnet werden, wird über die primären Kosten der produzierenden Kostenstelle berechnet.
Beispiel: Das Unternehmen hat eine Kantine. Die Mitarbeiter der Produktionsabteilung nutzen diese Kantine zum Mittagessen. Die sekundären Kosten der Produktionsabteilung sind somit die Kosten der Essen. Diese Kosten sind gleichzeitig auch primäre Kosten der Kantine (z.B. Stromkosten, Lebensmittelkosten, Lohnkosten des Kochs, ...).
Die Verteilung der sekundären Kosten auf die verbrauchenden Kostenstellen erfolgt über die Kostenstellenrechnung.