Die Fachhochschule Flensburg ist eine von 9 Fachhochschulen in Schleswig-Holstein. Die Hochschule hat zwei Fachbereiche: Wirtschaft und Technik.
Die Hochschule wurde 1886 als 'Königliche Seedampf-Maschinistenschule' gegründet und erhielt 1969 den Status einer "Staatliche Fachhochschule für Technik". Bis 1975 wurden an der FH vor allem Studierende der Schiffsbetriebstechnik ausgebildet, nach der Erweiterung des Hochschulkomplexes wurden dann unter anderem auch Elektrotechnik und Informatik angeboten.
1990 wurde die neuen Fachbereiche Wirtschaft eingeführt und 1994 die externen Standorte Heide bzw. Dithmarschen als Fachhochschule Westküste ausgegliedert.
Die FH hat zusammen mit der Universität Flensburg ein großes Hochschulzentrum, mit Mensa, Audimax und der Zentralen Hochschulbibliothek.
Im Jahre 2005 studierten etwa 3.000 Studenten an der Fachhochschule Flensburg.
Die Fachhochschule hatte im Jahr 2005 folgende Fachbereiche und Studiengänge: