Daniel Nathans (* 30. Oktober 1928 in Wilmington, Delaware, USA; † 16. November 1999 in Baltimore, Maryland, USA) war ein US-amerikanischer Mikrobiologe und Biochemiker.
1978 erhielt er zusammen mit Werner Arber und Hamilton Othanel Smith den Nobelpreis für Physiologie oder Medizin "für ihre Entdeckung der Restriktionsenzyme und der Anwendung dieser Enzyme in der Molekulargenetik".