Die Trachea (griech.), Mehrzahl Tracheen, ist ein Kanal, der für Tiere und Pflanzen verschiedene Funktionen ausbildet.
Die Zellen der meisten Insektenarten werden von den Tracheen mit Sauerstoff versorgt. Da Insekten kein Hämoglobin haben und so keinen Sauerstoff mit ihrem Blut transportieren können, und da sie ferner keine Lungen besitzen, muss der Sauerstoff direkt an die Zellen herangeführt werden. Ähnliche Organe finden sich bei Spinnen und Tausendfüßern.
Die Öffnungen der Tracheen befinden sich bei der Drosophila Melanogaster an der Unterseite des Hinterleibes. Sie bilden eine weitverzweigte Struktur aus und werden durch spiralartige Gebilde stabilisiert. Bei vielen Insektenarten sind die Öffnungen der Tracheen verschließbar, um zu verhindern, dass Wasser eintritt.
Die Pflanzen besitzen Tracheen zur Wasserversorgung der Zellen. Hier bilden sich die Tracheen infolge der Auflösung von Zellwänden an geeigneten Stellen.
Mit dem Wort Trachea wird in der Medizin die Luftröhre bezeichnet.