Der Schwarze See ist ein See auf der Ostseeinsel Rügen. Er gehört zur Gemarkung von Sellin und befindet sich im Waldgebiet Granitz.
Die Fläche des Sees beträgt 23 Hektar, seine größte Tiefe 15 Meter. Der nährstoffarme See gehört zu dem sehr seltenen Gewässertyp des sogenannten Kesselsees.
Im Randbereich finden Zwischenmoor- und Hochmoorbildung statt. Zum Teil besteht eine Schwingdeckenvegetation. Hier kommen Torfmoos, Wollgräser, Fieberklee, Moosbeere und Rosmarinheide vor.
Der komplette See, die am Rand bestehenden Moore und ein 100 Meter breiter Streifen des den See umschließenden Waldes sind als Kernzone (Totalreservat) des Biosphärenreservats Südost-Rügen ausgewiesen. Für Wanderer und Radwanderer ist der See jedoch vom von Binz nach Sellin führenden Wanderweg aus zugänglich. Über einen kleinen Holzsteg kann man bis auf den See gelangen.