Mit Papille bezeichnet man
- Erhebungen auf der Oberfläche von Pflanzen (z. B. den Blättern), siehe Papille (Botanik)
- eine Geschmacksknospe auf der Zunge (Papillae foliatae, - fungiformes, - vallatae)
- eine warzenartige Ausstülpung auf Organen oder Oberflächen, wie
- eine Verzahnung mehrschichtiger Epithelien, siehe Papillarkörper
- in der Augenheilkunde:
- die Austrittstelle des Sehnerven aus dem Augapfel (Papilla nervi optici, Sehnervenkopf) welche im Gesichtsfeld den Blinden Fleck verursacht
- polygonale, abgeplattete Vorwölbungen der Bindehaut, die im Zentrum eine feines Gefäßbäumchen aufweisen. Sie sind typisch für allergische Entzündungen.