Unter der Endlagerung versteht man allgemein die Entsorgung von Abfällen durch deren Verbringung in eine speziell dafür angelegte Einrichtung, das so genannte Endlager.
Eine Wiederverwertung ist in diesem Fall normalerweise nicht mehr vorgesehen, es sei denn, man trifft gezielte Vorkehrungen, um die Abfälle bei Bedarf wieder aus dem Endlager zu holen. In diesem Falle spricht man auch von "rückholbarer Endlagerung". Meist wird der Begriff im Zusammenhang mit der Entsorgung radioaktiver Abfälle verwendet.
Die Vorgehensweise bei der Endlagerung ist von Land zu Land verschieden. Fast alle Länder unterscheiden dabei zwischen der Art der radioaktiven Abfälle, insbesondere hinsichtlich des Aktivitätsgehalts. Bei hochradioaktiven Abfällen wird durchweg die Endlagerung in tiefen geologischen Formationen favorisiert. Ein Endlager für hochradioaktive Abfälle ist bisher jedoch noch nirgends in Betrieb. Schwach- und mittelradioaktive Abfälle werden jedoch oft oberflächennah in etwa 5-10 m Tiefe eingelagert. Diese Form der Endlagerung wird bereits in zahlreichen Ländern praktiziert, z.B. in Frankreich, Großbritannien, Spanien, Tschechien oder in den USA.
Das deutsche Endlagerungskonzept sieht vor, alle Arten von radioaktiven Abfällen in tiefen geologischen Formationen einzulagern. Im Unterschied zu früher und abweichend zu fast allen anderen Ländern soll dies in einem einzigen Endlager geschehen, das etwa 2030 verfügbar sein soll.