Die knapp 30 km lange Münstersche Aa ist ein Nebenfluss der Ems.
Sie enstspringt im nordwestlichen Nordrhein-Westfalen nur etwa 16 km westlich von Münster. Dort liegt ihre Quelle westlich der Kernstadt der Gemeinde Havixbeck am Nordost-Hang der Baumberge. Von dort aus fließt sie zuerst nur ein paar Kilometer nach Südosten und östlich vorbei an Roxel, um dann in Richtung Norden abzuknicken und in Münster den recht großen Aasee zu durchfließen.
Nachdem sie insbesondere in ihrem Oberlauf - oberhalb von Münster - von vielen kleinen Bächen gespeist wurde und diese Großstadt durchquert hat, mündet sie nur wenige Kilometer weiter nördlich bei Greven - ohne diese Stadt direkt zu erreichen - in die Ems.