San Rafael del Sur ist eine Stadt im Westen Nicaraguas, im Departamento Managua.
San Rafael del Sur hat 23.420 Einwohner (2005) und betreibt seit 1985 eine Städtepartnerschaft mit Berlin-Kreuzberg. Diese Städtepartnerschaft wird von dem Verein zur Förderung der Städtepartnerschaft Kreuzberg – San Rafael del Sur e.V. gepflegt.