Genetischer Code

Codierung von Peptidketten aus Aminosäuren durch Nukleotide
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Der genetische Code ist eine Anleitung, nach der Dreiergruppen (Triplets oder Codons) aufeinanderfolgender Nukleotide (oder Basen) während der Protein-Biosynthese in Aminosäuren übersetzt werden. Während dieses Prozesses werden die Basen der DNA eines Gens zunächst in ein mRNA-Molekül umgeschrieben (Transkription); danach können bestimmte Teile dieser mRNA gezielt entfernt werden (Spleißen). Schliesslich, während der Translation, werden die Aminosäuren der zu den Codons passenden tRNAs miteinander zu einer Polypeptidkette verknüpft. Einige Codons stehen nicht für eine Aminosäure, sondern werden als STOP-Zeichen behandelt, welches die Translation beendet.

So gut wie alle Lebewesen benutzen den selben genetischen Code. Die gebräuchlichste Version ist in den folgenden Tabellen angegeben. Sie zeigen, welche Aminosäuren von den 4³=64 möglichen Codons kodiert werden (Tabelle 1), und welche Codons jede der 20 in der Translation verwendeten Aminosäuren kodieren (Tabelle 2). So steht zum Beispiel GAU für die Aminosäure Asp (Asparagin), und Cys (Cystein) wird von den Codons UGU und UGC kodiert. Die in der Tabelle verwendeten Basen sind Adenin, Guanin, Cytosin und Uracil der mRNA; in der DNA wird statt Uracil Thymin verwendet.

Tabelle 1 : Codon-Tabelle. Diese Tabelle zeigt die 64 möglichen Codon-Triplets.
2nd base
U C A G
1. Base U

UUU Phenylalanin
UUC Phenylalanin
UUA Leucin
UUG Leucin

UCU Serin
UCC Serin
UCA Serin
UCG Serin

UAU Tyrosin
UAC Tyrosin
UAA Stop
UAG Stop

UGU Cystein
UGC Cysteine
UGA Stop
UGG Tryptophan

C

CUU Leucin
CUC Leucin
CUA Leucin
CUG Leucin

CCU Prolin
CCC Prolin
CCA Prolin
CCG Prolin

CAU Histidin
CAC Histidin
CAA Glutamin
CAG Glutamin

CGU Arginin
CGC Arginin
CGA Arginin
CGG Arginin

A

AUU Isoleucin
AUC Isoleucin
AUA Isoleucin
1AUG Methionin

ACU Threonin
ACC Threonin
ACA Threonin
ACG Threonin

AAU Asparagine
AAC Asparagine
AAA Lysine
AAG Lysine

AGU Serin
AGC Serin
AGA Arginin
AGG Arginin

G

GUU Valin
GUC Valin
GUA Valin
GUG Valin

GCU Alanin
GCC Alanin
GCA Alanin
GCG Alanin

GAU Asparaginsäure
GAC Asparaginsäure
GAA Glutaminsäure
GAG Glutaminsäure

GGU Glycin
GGC Glycin
GGA Glycin
GGG Glycin

1Das Triplet AUG dient sowohl als Codon für Methionin als auch als Startsignal der Translation; das erste AUG-Triplet auf der mRNA wird das erste Codon, das zu Protein translatiert wird.

Tabelle 2 : Umgekehrte Codon-Tabelle. Diese Tabelle zeigt die 20 Aminosäuren, die in Proteinen verwendet werden, und die Codons, die für sie kodieren.
Ala GCU, GCC, GCA, GCG Leu UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG
Arg CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG Lys AAA, AAG
Asn AAU, AAC Met AUG
Asp GAU, GAC Phe UUU, UUC
Cys UGU, UGC Pro CCU, CCC, CCA, CCG
Gln CAA, CAG Ser UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC
Glu GAA, GAG Thr ACU, ACC, ACA, ACG
Gly GGU, GGC, GGA, GGG Trp UGG
His CAU, CAC Tyr UAU, UAC
Ile AUU, AUC, AUA Val GUU, GUC, GUA, GUG
START AUG, GUG STOP UAG, UGA, UAA

Den drei STOP-Codons wurden ursprünglich Namen gegeben - UAG war amber (bernsteinfarben), UAG war opal, und UAA war ocker. Die Namen gehen zurück auf die Genen, bei denen das jeweilige Codon zuerst durch Mutation entdeckt wurde.

Die Translation beginnt mit einem Kettenstarter- oder START-Codon, aber dies alleine ist nicht ausreichend, und den Prozess zu beginnen. Bestimmte Initiationssequenzen nahe des START-Codons sind ebenfalls notwendig, um die Transkription in mRNA und deren Bindung am Ribosom herbeizuführen. Das wichtigste Startcodon ist AUG, das auch für Methionin codiert. CUG und UUG, sowie GUG und AUU in Prokaryoten, funktionieren ebenfalls.

It is notable that the standard genetic code contains features which provide for basic forms of error correction. Many codons which differ by only one base still encode the same amino acid and most often the single base that differs is the last one, which happens to be the base which is most often misread by the translation process. Furthermore, amino acids which tend to occur more frequently in proteins on average tend to have more codons which code for them.
Numerous variations on the standard genetic code are found inside mitochondria, energy-burning organelles that were probably derived from symbiotic bacteria. The Ciliophora or ciliate protozoa also show some variation in the genetic code: UAG and often UAA code for Glutamine, a variant also found in some green algae, or UGA codes for Cysteine. One more variant is found in some species of the yeast Candida, but interestingly not in all, where CUG codes for Serine. There are also a few "non-standard" amino acids which are substituted for some stop codons in some species of bacteria and archaea; UGA can code for selenocysteine and UAG can code for pyrrolysine. Other non-standard amino acids and codon interpretations may be present but currently unknown.
Despite these variations, the genetic code used by all known life on Earth displays a very large degree of similarity. Since there are many possible genetic codes that are thought to have similar utility to the one used by Earth life, the theory of evolution suggests that the genetic code was established very early in the history of life.