Francesco II. Maria Leopoldo wurde am 16. Januar 1836 in Neapel als Sohn von Fernando II. von Sizilien und dessen erster Gemahlin Maria Cristina von Sardinien geboren. Er folgte 1859 seinem Vater auf den Thron von Neapel und Sizilien. Am 3. Februar 1859 heiratete er in Bari Maria in Bayern, die ihm die Tochter Maria Cristina (* 24. Dezember 1869 - † 28. März 1870), Prinzessin von Sizilien, gebar.
Francesco II. starb am 27. Dezember 1894 in Arco.