Der Thunersee ist ein stehendes Gewässer am nördlichen Alpenrand. An seinem nördlichen Ausfluss, der Aare, ist die namengebende Stadt Thun zu finden. Bei Normalwasserstand liegt der Seespiegel auf 558 m.ü.M.
Der Thunersee tritt bei Starkregenfällen über die Ufer, da keine Seeregulierung besteht. Sein Hauptzufluss ist die Aare die vom 6 Meter höher im Südosten gelegenen Brienzersee gespiesen wird.