Die Mahnkesche Mühle ist die letzte erhalten gebliebene Mühle der deutschen Hansestadt Stralsund.
Es handelt sich um eine Erdholländermühle aus der zweiten Hälfte des 18. Jahrhunderts. Im Jahr 1958 wurde der Betrieb auf einen elektrischen Antrieb umgestellt. Noch bis in das Jahr 1968 wurde die Mühle betrieben.
Im Jahr 1980 wurden Teile der Mühle, zu der auch ein Speicher, ein Maschinenhaus und ein Mühlenhaus gehören, durch einen Brand beschädigt. Es ist geplant, die Mühle, die auf einem Areal namens Mahnkesche Wiesen nahe des Rügendamms steht, abzubauen und im Stralsunder Tierpark wieder originalgetreu zu errichten.
Die Mühle ist nun nahezu vollständig abgetragen worden (Stand: Mitte Mai 2006).