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„Kollagen-Typ 2α1“ – Versionsunterschied

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== Genstruktur ==
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COL2A1 beinhaltet insgesamt 67 [[Exon]]s. Das Gen befindet sich auf dem langen Chromosomenarm (q-Arm) auf der Chromosomenbande 12q13.11 des [[Chromosom 12 (Mensch)|Chromosoms 12]].<ref name="National Center for Biotechnology Information (NCBI)"> {{Internetquelle |url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/1280 |titel=COL2A1 collagen, type II, alpha 1 Homo sapiens (human) |titelerg= |autor= |hrsg=National Center for Biotechnology Information (NCBI) |werk= |seiten= |datum= |archiv-url= |archiv-datum= |zugriff=2015-12-23 |sprache=englisch |format= |kommentar= |zitat= |offline=}}</ref>
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== Funktion ==
== Funktion ==
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=== Interaktion mit anderen Proteinen ===
=== Interaktion mit anderen Proteinen ===
COL2A1 interagiert insgesamt mit 24 Proteinen:<ref name="National Center for Biotechnology Information (NCBI)" />
COL2A1 interagiert insgesamt mit 23 Proteinen:<ref name="National Center for Biotechnology Information (NCBI)" />

{|


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* [[ANXA5]]
== Posttranslationale Modifikation ==

* [[BGN (Gen)|BGN]]

* [[BMP2]]

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* [[C1AQ]]

* [[CHAD]]

* [[COL6A1]]

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* [[COL9A2]]

* [[COL9A3]]

* [[COMP]]

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* [[DDR1 (Gen)|DDR1]]

* [[FGF7]]

* [[FN1]]

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* [[HTRA1]]

* [[ITGA2B]]

* [[LOXL4]]

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* [[MAG (Gen)|MAG]]

* [[MATN1]]

* [[MMP1]]

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* [[MMP13]]

* [[PCOLCE]]

* [[PKD1]]

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* [[PRELP]]

* [[Osteonectin|SPARC]]

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== Klinische Signifikanz ==
== Klinische Signifikanz ==
Mutationen im Gen COL2A1 könnten folgende Krankheiten verursachen:

* '''Achondrogenesie Typ II''': Bei diesem Typ kann eine abnormale Pro-alpha-1(II)-Kette entdeckt werden, das die Produktion einer Kollagenfibrille Typ II beeinträchtigt. Dies wird durch einen [[Einzelnukleotid-Polymorphismus]] verursacht, der dazu führt, dass die Aminosäure [[Glycin]] gegen [[Serin]] an der Nukleotidposition 942 [[Substitutionsreaktion|substituiert]] wird.

* '''Dysplasie, epiphysäre multiple, Typ Beighton''': Verursacht wird dies durch eine heterozygote [[Cytosin|C]]-[[Thymin|T]]-[[Transversion]] an der Nukleotidposition 2503 des Exons 39 des COL2A1-Gens. Dies wiederum resultiert in eine Substitution von [[Arginin]] gegen [[Cystein]] an der Position 704, häufig vorkommend an der X-Position des Gly-X-Y-[[Basentriplett|Triplett]]s der Kollagen-Tripelhelix.

* '''[[Hypochondrogenesie]]''': Ursache ist eine G-[[Adenin|A]]-[[Transition (Genetik)|Transition]], das zu eine Substitution von Glycin gegen Serin an der Position 943 oder 574 führt. Dadurch wird der interzelluläre Transport und die Sekretion der Kollagenmoleküle beeinträchtigt, sowie die Kollagenfibrille getrennt.

* '''Kniest-Dysplasie''': Es wird eine abnormal kurze Pro-alpha-I(II)-Kette produziert. Es kommt zur [[Vernetzung (Chemie)|Vernetzung]] mit normal langen Kollagenketten. Das Resultat ist, dass die Kollagenmoleküle Typ II kürzer als normal sind.

* '''Kongenitale Spondyloepiphysäre Dysplasie''':

* '''[[Morbus Perthes]]''':

* '''Osteoarthritis, früh beginnende, mit milder spondyloepiphysäre Dysplasie''':

* '''[[Oto-spondylo-megaepiphysäre Dysplasie]]''':

* '''Platyspondyle letale Skelettdysplasie Typ Torrance''':

* '''Proliferative Vitreoretinopathie, mit phalangealer epiphysärer Dysplasie''':

* '''Spondyloepiphysäre Dysplasie Typ Namaqualand''':

* '''Spondyloepimetaphysäre Dysplasie Typ Stanescu''':

* '''Spondyloepimetaphysäre Dysplasie Typ Strudwick''':

* '''Spondyloperiphere Dysplasie'''

* '''Stickler-Syndrom Typ I''':

* '''Stickler-Syndrom Typ III''':

* '''Tschechische Dysplasie, metatarsaler Typ''':


== Tiermodell ==
== Tiermodell ==

Version vom 23. Dezember 2015, 19:10 Uhr

Kollagen Typ II, alpha 1
Kollagen Typ II, alpha 1
nach PDB 3HR2
Andere Namen
  • Alpha-1 Typ II Kollagen
  • Kollagen II, Alpha-1 Polypeptid
  • Kollagen Alpha-1(II)-Kette

Vorhandene Strukturdaten: 2FSE, 2SEB

Eigenschaften des menschlichen Proteins
Masse/Länge Primärstruktur 141.785 Dalton / 1.487 Aminosäuren (Isoform1)

170.385 Dalton / 1.535 Aminosäuren (Isoform2)

170.274 Dalton / 1.534 Aminosäuren (Isoform3)

131.313 Dalton / 1.535 Aminosäuren (Isoform4)

Präkursor Pro-alpha 1(II)-Kollagen
Isoformen 4
Bezeichner
Gen-Namen COL2A1 ;, ANFH; AOM; SEDC; STL1
Externe IDs
Vorkommen
Homologie-Familie Hovergen
Übergeordnetes Taxon Eukaryoten
Orthologe
Mensch Hausmaus
Entrez 1280 12824
Ensembl ENSG00000139219 ENSMUSG00000022483
UniProt P02458 P28481
Refseq (mRNA) NM_001844 NM_001113515
Refseq (Protein) NP_001835 NP_001106987
Genlocus Chr 12: 47.97 – 48 Mb Chr 15: 97.98 – 98 Mb
PubMed-Suche 1280 12824

Kollagen Typ II, alpha 1, auch bekannt als Alpha-1 Typ II Kollagen, ist ein Protein, das im menschlichen Organismus vom Gen COL2A1 codiert wird. Bei Säugetieren fungiert Kollagen Typ II, ein fibrilläres Kollagen, als Strukturprotein des hyalinen und des elastischen Knorpels. Besonders stark exprimiert ist COL2A1 im Glaskörper, im Gallertkern (Nucleus pulposus) der Bandscheibe und im Innenohr.[1]

Geschichte

Elisabeth Weiss, ehemalige C3-Professorin für molekulare Humangenetik der Ludwig-Maximilians-Universität München, beschrieb 1982 ein isoliertes Kollagen-Gen in einem 40 kb langen Cosmid-Klon (cosHco11), welches Homologien mit der Nukleotidsequenz des alpha-1(I)-Gens aufwies, aber offensichtlich ein differentes Gen war.[2]

1984 führte die US-amerikanische Genetikerin Ellen Solomon eine molekularbiologische Untersuchungsmethode für die aus somatischen Zellen stammender DNA, welches sich Southern Blot nennt, durch, um die Gensequenz des noch nicht identifizierten Gens zu untersuchen. Es stellte sich heraus, dass das Gen sich auf dem Chromosom 17 befindet und keine Syntenie zwischen COL1A2 oder COL1A1 aufwies.[3]

Francis Michael Pope, walisischer Klinikalgenetiker, stellte 1984 bei einer Deletion von 300 bp fest, dass dieses mutierte Gen das Ehlers-Danlos-Syndrom (Klassischer Typ) auslöste. Die Deletion wurde in der Nähe des 3'-Endes des Gens entdeckt. Ebenso wurde dieses mutierte Gen bei vier Babys entdeckt, die unter der letalen Osteogenesis imperfecta Typ III litten.[4]

Charles Strom, US-amerikanischer Genetiker, bestätigte 1984 die Abnormalität dieses Gens (welches inzwischen COL2A1 genannt wurde) bei einer Mutation am Beispiel von Achondroplasie und kongenitaler spondyloepiphysärer Dysplasie.[5]

1985 entdeckte der Humangenetiker Bryan Sykes, dass dieses Gen die alpha-Untereinheit des Kollagens in den Knorpeln codiert. Außerdem stellte man einen Polymorphismus in diesem Gen fest, das oft bei Indern entdeckt wurde.[6]

Subzelluläre Lokalisation

COL2A1 befindet sich vermehrt im endoplasmatischen Retikulum, was signifikant für die Proteinbiosynthese ist. Außerdem kommt es im Extrazellularraum, Cytoplasma, Lysosom, Mitochondrium, Nukleus und Peroxisom vor.[1]

Genstruktur

COL2A1 beinhaltet insgesamt 67 Exons. Das Gen befindet sich auf dem langen Chromosomenarm (q-Arm) auf der Chromosomenbande 12q13.11 des Chromosoms 12.[7]

Funktion

Kollagen Typ II ist essenziell für das Knorpelgewebe. Außerdem ist es relevant für die normale embryonale Entwicklung des Skeletts, das lineare Wachstum und die Fähigkeit des Knorpelgewebes Druckkräfte zu resistieren.[8] Mutationen in diesem Gen werden vor allem assoziiert mit der Achondrogenesie Typ II, Skelettdysplasie, Arthrose, kongenitalen spondyloepiphysären Dysplasie, Kniest-Dysplasie, dem Stickler-Syndrom Typ I, der spondyloepimetaphysären Dysplasie Typ Strudwick und weiteren Krankheiten.[1]

Interaktion mit anderen Proteinen

COL2A1 interagiert insgesamt mit 23 Proteinen:[7]

Klinische Signifikanz

Mutationen im Gen COL2A1 könnten folgende Krankheiten verursachen:

  • Achondrogenesie Typ II: Bei diesem Typ kann eine abnormale Pro-alpha-1(II)-Kette entdeckt werden, das die Produktion einer Kollagenfibrille Typ II beeinträchtigt. Dies wird durch einen Einzelnukleotid-Polymorphismus verursacht, der dazu führt, dass die Aminosäure Glycin gegen Serin an der Nukleotidposition 942 substituiert wird.
  • Dysplasie, epiphysäre multiple, Typ Beighton: Verursacht wird dies durch eine heterozygote C-T-Transversion an der Nukleotidposition 2503 des Exons 39 des COL2A1-Gens. Dies wiederum resultiert in eine Substitution von Arginin gegen Cystein an der Position 704, häufig vorkommend an der X-Position des Gly-X-Y-Tripletts der Kollagen-Tripelhelix.
  • Hypochondrogenesie: Ursache ist eine G-A-Transition, das zu eine Substitution von Glycin gegen Serin an der Position 943 oder 574 führt. Dadurch wird der interzelluläre Transport und die Sekretion der Kollagenmoleküle beeinträchtigt, sowie die Kollagenfibrille getrennt.
  • Kniest-Dysplasie: Es wird eine abnormal kurze Pro-alpha-I(II)-Kette produziert. Es kommt zur Vernetzung mit normal langen Kollagenketten. Das Resultat ist, dass die Kollagenmoleküle Typ II kürzer als normal sind.
  • Kongenitale Spondyloepiphysäre Dysplasie:
  • Osteoarthritis, früh beginnende, mit milder spondyloepiphysäre Dysplasie:
  • Platyspondyle letale Skelettdysplasie Typ Torrance:
  • Proliferative Vitreoretinopathie, mit phalangealer epiphysärer Dysplasie:
  • Spondyloepiphysäre Dysplasie Typ Namaqualand:
  • Spondyloepimetaphysäre Dysplasie Typ Stanescu:
  • Spondyloepimetaphysäre Dysplasie Typ Strudwick:
  • Spondyloperiphere Dysplasie
  • Stickler-Syndrom Typ I:
  • Stickler-Syndrom Typ III:
  • Tschechische Dysplasie, metatarsaler Typ:

Tiermodell

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c Kollagen-Typ 2α1. In: GeneCards (englisch).
  2. ↑ E. H. Weiss, K. S. Cheah: Isolation and characterization of a human collagen alpha 1(I)-like gene from a cosmid library. In: PubMed. National Center for Biotechnology Information (NCBI), 25. März 1982, PMID 6281728 (englisch, nih.gov).
  3. ↑ Kollagen-Typ 2α1. In: Online Mendelian Inheritance in Man. (englisch)
  4. ↑ F. M. Pope, K. S. Cheah: Lethal osteogenesis imperfecta congenita and a 300 base pair gene deletion for an alpha 1(I)-like collagen. In: PubMed. National Center for Biotechnology Information (NCBI), 11. Februar 1984, PMID 6419953 (englisch, nih.gov).
  5. ↑ C. M. Strom: Achondroplasia due to DNA insertion into the type II collagen gene. In: Patriatric Research. Nature, 1984, doi:10.1203/00006450-198404001-00800 (englisch, nature.com).
  6. ↑ B. Sykes, R. Smith: Exclusion of the alpha-1(II) cartilage collagen gene as the mutant locus in type IA osteogenesis imperfecta. In: Journal of Medical Genetics. British Medical Journal (BMJ), 1984 (englisch, bmj.com [PDF]).
  7. ↑ a b COL2A1 collagen, type II, alpha 1 Homo sapiens (human). In: National Center for Biotechnology Information (NCBI), abgerufen am 23. Dezember 2015 (englisch).
  8. ↑ UniProt P02458
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