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„Simplified Molecular Input Line Entry System“ – Versionsunterschied

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'''SMILES''' ('''S'''implified '''M'''olecular '''I'''nput '''L'''ine '''E'''ntry '''S'''pecification) ist ein von [[David Weininger]] entwickelter [[Chemie|chemischer]] Strukturcode.
'''Simplified Molecular Input Line Entry Specification''' ('''SMILES''') ist ein von [[David Weininger]] entwickelter [[Chemie|chemischer]] Strukturcode.
Strukturen werden stark vereinfacht als [[Zeichenkette]] wiedergegeben.
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: CC = CH<sub>3</sub>-CH<sub>3</sub> [[Ethan]]
: CC = CH<sub>3</sub>-CH<sub>3</sub> [[Ethan]]
: CCC = CH<sub>3</sub>-CH<sub>2</sub>-CH<sub>3</sub> [[Propan]]
: CCC = CH<sub>3</sub>-CH<sub>2</sub>-CH<sub>3</sub> [[Propan]]
: Clc(c(Cl)c(Cl)c1C(=O)O)c(Cl)c1Cl = C<sub>7</sub>HCl<sub>5</sub>O<sub>2</sub> [[Pentachlorbenzoesäure]]
: Clc(c(Cl)c(Cl)c1C(=O)O)c(Cl)c1Cl = C<sub>7</sub>HCl<sub>5</sub>O<sub>2</sub> [[Pentachlorbenzoesäure]]


Zur Eingabe von Atomen eines [[Chemisches Element|Element]]s genügt die gewöhnliche Abkürzung in eckigen Klammern (z. B. [Au] für [[Gold]]). Die Klammern können bei einigen Elemente weggelassen werden: B, C, N, O, P, S, F, Cl, Br, und I. Werden die eckigen Klammern weggelassen, so werden jedoch automatisch Wasserstoffatome hinzugefügt, zum Beispiel reicht für Wasser die Eingabe von O.
Zur Eingabe von Atomen eines [[Chemisches Element|Element]]s genügt die gewöhnliche Abkürzung in eckigen Klammern (z. B. [Au] für [[Gold]]). Die Klammern können bei einigen Elemente weggelassen werden: B, C, N, O, P, S, F, Cl, Br, und I. Werden die eckigen Klammern weggelassen, so werden jedoch automatisch Wasserstoffatome hinzugefügt, zum Beispiel reicht für Wasser die Eingabe von O.


''Siehe auch:'' [[WLN]] (WISWESSER Line Notation), [[Chemische Formel]], [[Konstitutionsformel]]
''Siehe auch:'' [[Wiswesser Line Notation]] (WLN), [[Chemische Formel]], [[Konstitutionsformel]]


==Erweiterung==
== Erweiterung ==
SMARTS ist eine Erweiterung von SMILES, die das Suchen nach molekularen Substrukturen ermöglicht. Hierzu wurde SMILES, um Wildcards oder spezifische Bindungen (z.&nbsp;B. aromatische) anzugeben, modifiziert. Es gilt, dass jeder gültige SMILES-Ausdruck ebenfalls als SMARTS verwendet werden darf. Diese Regel gilt andersherum nicht. SMARTS werden vor allem für Suchanwendungen bei chemischen Datenbanken verwendet.
SMARTS ist eine Erweiterung von SMILES, die das Suchen nach molekularen Substrukturen ermöglicht. Hierzu wurde SMILES, um Wildcards oder spezifische Bindungen (z.&nbsp;B. aromatische) anzugeben, modifiziert. Es gilt, dass jeder gültige SMILES-Ausdruck ebenfalls als SMARTS verwendet werden darf. Diese Regel gilt andersherum nicht. SMARTS werden vor allem für Suchanwendungen bei chemischen Datenbanken verwendet.


==Weblinks==
== Weblinks ==
*http://daylight.com/smiles/ SMILES- Website
* http://daylight.com/smiles/ SMILES-Website
*http://daylight.com/daycgi_tutorials/depict.cgi Konvertierer von SMILES in Strukturformeln (wurde z.B. für Bild [[Histamin]] verwendet)
* http://daylight.com/daycgi_tutorials/depict.cgi Konvertierer von SMILES in Strukturformeln (wurde z.B. für Bild [[Histamin]] verwendet)
*http://www.syrres.com/esc/docsmile.htm Beschreibung der Sprache
* http://www.syrres.com/esc/docsmile.htm Beschreibung der Sprache
*[http://www.vcclab.org/lab/alogps E-BABEL] wechselwirkende Umwandlung der Moleküle auf dem Netz mit [http://openbabel.sourceforge.net/ OpenBabel]
* [http://www.vcclab.org/lab/alogps E-BABEL] wechselwirkende Umwandlung der Moleküle auf dem Netz mit [http://openbabel.sourceforge.net/ OpenBabel]
* [http://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smarts.html "SMARTS - SMILES Extension"] Einführung in SMARTS
* [http://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smarts.html „SMARTS - SMILES Extension“] Einführung in SMARTS




===Computerprogramme===
=== Computerprogramme ===
* [http://www.daylight.com/daycgi/depict Daylight Depict] Visualisierung eines SMILES als Molekül
* [http://www.daylight.com/daycgi/depict Daylight Depict] Visualisierung eines SMILES als Molekül
* [http://www.daylight.com/daycgi_tutorials/depictmatch.cgi] Suchen nach molekularen Substrukturen
* [http://www.daylight.com/daycgi_tutorials/depictmatch.cgi] Suchen nach molekularen Substrukturen
*http://www.molinspiration.com/jme/index.html JME SMILES Editor
*http://www.molinspiration.com/jme/index.html JME SMILES Editor
*[http://www.epa.gov/opptintr/exposure/docs/episuite.htm SMILECAS Datenbank]
*[http://www.epa.gov/opptintr/exposure/docs/episuite.htm SMILECAS Datenbank]



[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:Chemie]]

Version vom 2. September 2007, 14:01 Uhr

Simplified Molecular Input Line Entry Specification (SMILES) ist ein von David Weininger entwickelter chemischer Strukturcode. Strukturen werden stark vereinfacht als Zeichenkette wiedergegeben.

C = CH4 Methan
CC = CH3-CH3 Ethan
CCC = CH3-CH2-CH3 Propan
Clc(c(Cl)c(Cl)c1C(=O)O)c(Cl)c1Cl = C7HCl5O2 Pentachlorbenzoesäure

Zur Eingabe von Atomen eines Elements genügt die gewöhnliche Abkürzung in eckigen Klammern (z. B. [Au] für Gold). Die Klammern können bei einigen Elemente weggelassen werden: B, C, N, O, P, S, F, Cl, Br, und I. Werden die eckigen Klammern weggelassen, so werden jedoch automatisch Wasserstoffatome hinzugefügt, zum Beispiel reicht für Wasser die Eingabe von O.

Siehe auch: Wiswesser Line Notation (WLN), Chemische Formel, Konstitutionsformel

Erweiterung

SMARTS ist eine Erweiterung von SMILES, die das Suchen nach molekularen Substrukturen ermöglicht. Hierzu wurde SMILES, um Wildcards oder spezifische Bindungen (z. B. aromatische) anzugeben, modifiziert. Es gilt, dass jeder gültige SMILES-Ausdruck ebenfalls als SMARTS verwendet werden darf. Diese Regel gilt andersherum nicht. SMARTS werden vor allem für Suchanwendungen bei chemischen Datenbanken verwendet.


Computerprogramme

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